RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 TLR1Q15399 786 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF549Q6P9A3 640 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ISLR2Q6UXK2 745 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 DENND6AQ8IWF6 608 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 PARP9Q8IXQ6 854 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJB14Q8TBM8 379 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 CALML6Q8TD86 181 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 SYNPO2LQ9H987 977 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 DHRS7Q9Y394 339 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 SMAPO00193 183 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 COX6A1P12074 109 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 COILP38432 576 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 CTBP1Q13363 440 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 LONRF1Q17RB8 773 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 HKDC1Q2TB90 917 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 VWA2Q5GFL6 755 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 CYHR1Q6ZMK1 362 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFAF7Q7L592 441 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 KBTBD2Q8IY47 623 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 CD200R1Q8TD46 325 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF160Q9HCG1 818 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 IDSB3KWA1 339 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB14O43829 449 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 KIF5CO60282 957 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 FAM53BQ14153 422 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 KCNMB4Q86W47 210 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 AMER3Q8N944 861 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 NAT8LQ8N9F0 302 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 PPFIBP2Q8ND30 876 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf34Q96MH7 638 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 MESP1Q9BRJ9 268 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 DRC3Q9H069 523 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 TRPC4Q9UBN4 977 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 TEX15Q9BXT5 2789 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 E2F3O00716 465 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 ANXA5P08758 320 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 HRH2P25021 359 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 IMPA1P29218 277 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 SOX11P35716 441 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 EMP2P54851 167 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 CUL1Q13616 776 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 LAPTM4BQ86VI4 370 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS58Q8IYP2 241 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP19.94■□□□□ 0.782e-8■■□□□ 12.2
LIMS1-208ENST00000428064 GRK7Q8WTQ7 553 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 C8orf44Q96CB5 159 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A14Q96JA4 679 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 SIGLEC10Q96LC7 697 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 GPR21Q99679 349 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 FAM167BQ9BTA0 163 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 PCYOX1Q9UHG3 505 aa19.94■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8MH3BSY2 632 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 FOXS1O43638 330 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL18O94889 574 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINA7P05543 415 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 CYC1P08574 325 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 PRR35P0CG20 571 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 EDN3P14138 238 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 CXCR2P25025 360 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 FNTAP49354 379 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 CDC16Q13042 620 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFA9Q16795 377 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 GRHL3Q8TE85 626 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 FAR1Q8WVX9 515 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 PSMF1Q92530 271 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 RIC8BQ9NVN3 520 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO5Q9UKT4 447 aa19.93■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 HAT1O14929 419 aa19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 SYF2O95926 243 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 AP2B1P63010 937 aa19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 INAQ16352 499 aa19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms