RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 YBX1P67809 324 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RELAQ04206 551 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OCA2Q04671 838 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IL10RAQ13651 578 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF460Q14592 562 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SSPNQ14714 243 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLMAPQ14BN4 828 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NDUFA9Q16795 377 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PHKG1Q16816 387 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF425Q6IV72 752 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRMT9Q6P2P2 845 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LCTLQ6UWM7 567 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAPH1Q70E73 1250 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF605Q86T29 641 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR4N4Q8N0Y3 316 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF843Q8N446 348 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTERQ96BW5 349 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FBXL8Q96CD0 374 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IP6K3Q96PC2 410 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 YIPF2Q9BWQ6 316 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SEMA4CQ9C0C4 833 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF304Q9HCX3 659 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TLK1Q9UKI8 766 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATRXP46100 2492 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARGFXA6NJG6 315 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HAT1O14929 419 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGHEP01854 428 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ALBP02768 609 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CAPN1P07384 714 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HNMTP50135 292 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PMS2P54278 862 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EMP3P54852 163 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NFKB2Q00653 900 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CSHL1Q14406 222 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GARNL3Q5VVW2 1013 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM207Q6UWW9 146 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OVCH1Q7RTY7 1134 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CEP97Q8IW35 865 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FKBP10Q96AY3 582 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 THAP11Q96EK4 314 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VPS50Q96JG6 964 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYTH2Q99418 400 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FMO2Q99518 471 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR22Q99680 433 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CAB39LQ9H9S4 337 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OARD1Q9Y530 152 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IKBKGQ9Y6K9 419 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAU2Q9Y6X3 613 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COL6A6A6NMZ7 2263 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC88CQ9P219 2028 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KALRNO60229 2985 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 B8ZZF3 427 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDC7O00311 574 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NRP2O60462 931 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 S100BP04271 92 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC166P0CW27 439 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDH1P12830 882 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FBLP22087 321 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CRABP2P29373 138 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR1D4P47884 311 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCL11P51671 97 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCR8P51685 355 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAB10P61026 200 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP6V0D1P61421 351 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDKL1Q00532 357 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SBSNQ6UWP8 590 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MED25Q71SY5 747 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLD3Q8IV08 490 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IFT20Q8IY31 132 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TCAIMQ8N3R3 496 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CAMKVQ8NCB2 501 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR56A3Q8NH54 315 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PYCR2Q96C36 320 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MVB12AQ96EY5 273 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms