RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 KRT222Q8N1A0 295 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 MARVELD2Q8N4S9 558 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CSNK1A1LQ8N752 337 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM178AQ8NBL3 297 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ASZ1Q8WWH4 475 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ALS2CR12Q96Q35 445 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FERMT1Q9BQL6 677 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 DPH7Q9BTV6 452 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CARD6Q9BX69 1037 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 MROH6A6NGR9 719 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FAM90A27PA6NNH2 459 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf105O95561 183 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 RBP3P10745 1247 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 MEP1AQ16819 746 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A25Q6KCM7 469 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 TTC23LQ6PF05 361 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 EID3Q8N140 333 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 HMGCLL1Q8TB92 370 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 METTL21AQ8WXB1 218 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CYTH2Q99418 400 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CHP1Q99653 195 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ACAT2Q9BWD1 397 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 VN1R1Q9GZP7 353 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 ACANP16112 2415 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 NEURL1O76050 574 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 STK10O94804 968 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 TOXO94900 526 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 APOA4P06727 396 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 AOAHP28039 575 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 PTGER1P34995 402 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC38Q502W7 563 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC181Q5TID7 509 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 CES4AQ5XG92 561 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 LILRB4Q8NHJ6 448 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC45Q96CN5 670 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 DLL4Q9NR61 685 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 RNF6Q9Y252 685 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 MACROD2A1Z1Q3 448 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 OR2W5A6NFC9 320 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM200CA6NKL6 621 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 F8W8V4 182 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 METTL18O95568 372 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 GOT2P00505 430 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 MSX1P28360 303 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 CMPK1P30085 196 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 SEMA3AQ14563 771 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 TCEAL1Q15170 157 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 MAPKAPK3Q16644 382 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 GARNL3Q5VVW2 1013 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 OR13J1Q8NGT2 312 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 FAM57AQ8TBR7 257 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 ASB5Q8WWX0 329 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 KRT35Q92764 455 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 HDAC10Q969S8 669 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 LIME1Q9H400 295 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 KCNN3Q9UGI6 736 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 VPS13CQ709C8 3753 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 GABRR3A8MPY1 467 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 VPS26AO75436 327 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 TPOP07202 933 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF24P17028 368 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 CHRNB4P30926 498 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 FOLH1Q04609 750 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 CD163Q86VB7 1156 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 PAQR7Q86WK9 346 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 RAB42Q8N4Z0 105 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 NINJ1Q92982 152 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 OR2A5Q96R48 311 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 TTC1Q99614 292 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 PLCD4Q9BRC7 762 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 TSSK1BQ9BXA7 367 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 DRC3Q9H069 523 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 LRFN1Q9P244 771 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GTH9 108 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms