RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 CXCR2P25025 360 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PSMB5P28074 263 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CCNFP41002 786 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 DR1Q01658 176 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MORF4L2Q15014 288 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MUM1Q2TAK8 710 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CTSL3PQ5NE16 218 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 NDUFAF7Q7L592 441 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 OTOAQ7RTW8 1153 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CILP2Q8IUL8 1156 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 LMNTD2Q8IXW0 634 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 KRT222Q8N1A0 295 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 OR2L3Q8NG85 312 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 NR4A3Q92570 626 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 RELTQ969Z4 430 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 C8orf44Q96CB5 159 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CABS1Q96KC9 395 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 FOPNLQ96NB1 174 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 C14orf105Q9NVL8 296 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PTGFRNQ9P2B2 879 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ASIC3Q9UHC3 531 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 KLK4Q9Y5K2 254 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 OTOGQ6ZRI0 2925 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 A0A0J9YVX5 310 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 TTI1O43156 1089 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 VPS26AO75436 327 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 SERPINA7P05543 415 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PRR35P0CG20 571 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PAMP19021 973 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PAFAH1B1P43034 410 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 BDKRB1P46663 353 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 TNFSF10P50591 281 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 TERF1P54274 439 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 KCNK10P57789 538 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 AP2B1P63010 937 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MSS51Q4VC12 460 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ATG9BQ674R7 924 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 FRMPD2BQ6IN97 320 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 NEPROQ6NW34 567 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MTFR2Q6P444 385 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 GFRALQ6UXV0 394 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 RNF44Q7L0R7 432 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 KLHL7Q8IXQ5 586 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 DTWD1Q8N5C7 304 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 HMGCLL1Q8TB92 370 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MESP1Q9BRJ9 268 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 YIPF2Q9BWQ6 316 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.531e-15■■■□□ 14.8
PRAME-204ENST00000403441 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 TRPC4Q9UBN4 977 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 IDSB3KWA1 339 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 E7ESA3 106 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 WFS1O76024 890 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 BMP10O95393 424 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MED26O95402 600 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 C1orf105O95561 183 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CRYABP02511 175 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ESR1P03372 595 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ANXA5P08758 320 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MYBL2P10244 700 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 COX6A1P12074 109 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PGAM1P18669 254 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ATP5DP30049 168 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CMPK1P30085 196 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 SOX11P35716 441 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 TDGF1P3P51864 188 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 EMP2P54851 167 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 EMP3P54852 163 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ART3Q13508 389 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 DSG2Q14126 1118 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CRYMQ14894 314 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.532e-8■□□□□ 10
PRAME-204ENST00000403441 VWA2Q5GFL6 755 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 TMEM207Q6UWW9 146 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms