RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 LGR4Q9BXB1 951 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CMAHPQ9Y471 501 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PRNPP04156 253 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF806P0C7X5 589 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GLDCP23378 1020 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CBFBQ13951 182 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 BTBD16Q32M84 506 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GSTT2BP0CG30 244 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CKMT1AP12532 417 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 HK1P19367 917 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ECHS1P30084 290 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ARSFP54793 590 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PLD4Q96BZ4 506 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 LRCH3Q96II8 777 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 UPB1Q9UBR1 384 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PRELID1Q9Y255 219 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PGAM2P15259 253 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ARSIQ5FYB1 569 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CALML5Q9NZT1 146 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.83□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.83□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TUBA4AP68366 448 aa14.83□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DPY19L1Q2PZI1 675 aa14.83□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 OSTM1Q86WC4 334 aa14.83□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GPR88Q9GZN0 384 aa14.83□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 XKR4Q5GH76 650 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 UCK2Q9BZX2 261 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CDK6Q00534 326 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 GPR135Q8IZ08 494 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF676Q8N7Q3 588 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 GJA1P17302 382 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 NANOGP8Q6NSW7 305 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SPATC1Q76KD6 591 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 NANOGQ9H9S0 305 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF639Q9UID6 485 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 C6orf47O95873 294 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SELPP16109 830 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ACADLP28330 430 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ACADVLP49748 655 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ELOA3Q8NG57 546 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 BCO2Q9BYV7 579 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.83□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CNTN5O94779 1100 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RPA4Q13156 261 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FUZQ9BT04 418 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 OR51B5Q9H339 312 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A1B0GVT2 93 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM170BA6NMN3 283 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SOCS2O14508 198 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PDCD5O14737 125 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms