RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 FBXO24O75426 580 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 CTAG2O75638 210 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 TSPAN12O95859 305 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 LY6G6DO95868 133 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 FDXRP22570 491 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 DNASE1P24855 282 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 SHMT2P34897 504 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 GJC1P36383 396 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 GRIA3P42263 894 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 CARSP49589 748 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 RAB28P51157 221 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 EFNA3P52797 238 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 ARSFP54793 590 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 DLX5P56178 289 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF33BQ06732 778 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 ITGA9Q13797 1035 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 KRT31Q15323 416 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC14A2Q15849 920 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 ABHD17BQ5VST6 288 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRFN4Q6PJG9 635 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZZZ3Q8IYH5 903 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 BEST3Q8N1M1 668 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 GHDCQ8N2G8 530 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC25A41Q8N5S1 370 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 KCT2Q8NC54 265 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 MDS2Q8NDY4 140 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 SUN3Q8TAQ9 357 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF398Q8TD17 642 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 HDAC10Q969S8 669 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 MIEF2Q96C03 454 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAF2Q96CS3 445 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 SCMH1Q96GD3 660 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 VPS50Q96JG6 964 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 PWWP2AQ96N64 755 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF285Q96NJ3 590 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 RIC8BQ9NVN3 520 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 ANKRD10Q9NXR5 420 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 RNF6Q9Y252 685 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 JMJD1CQ15652 2540 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 DOCK10Q96BY6 2186 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 FITM1A5D6W6 292 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 ISM1B1AKI9 464 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 IDSB3KWA1 339 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRRG2O14669 202 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 KLK8O60259 260 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 SRP72O76094 671 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 TPOP07202 933 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 PYGMP11217 842 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 FERP16591 822 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 CHRNB4P30926 498 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 HOXC12P31275 282 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 PTGER1P34995 402 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 CD151P48509 253 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 DGKQP52824 942 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 EMP2P54851 167 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 WNT3AP56704 352 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 XIAPP98170 497 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 OCA2Q04671 838 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 TUBA3CQ13748 450 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 GRM7Q14831 915 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR1C1Q15619 314 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 FKBP15Q5T1M5 1219 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPINK14Q6IE38 97 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 FRMPD2BQ6IN97 320 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 TUBA3EQ6PEY2 450 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 KDELC1Q6UW63 502 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 PAMR1Q6UXH9 720 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-398P-201ENST00000384143 TAX1BP1Q86VP1 789 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms