RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384105.1

RNU6V-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear variant sequence with SNRPE pseudogene sequence, humanhuman

BASIC

Gene RNU6V, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6V-201ENST00000384105 DAB1O75553 588 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PRDM1O75626 825 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CEACAM4O75871 244 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DFFBO76075 338 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 WISP2O76076 250 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GFPT2O94808 682 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SLITRK3O94933 977 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 FTCDO95954 541 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ACTL6AO96019 429 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 IGLV1-47P01700 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 VTNP04004 478 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 IFNW1P05000 195 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 IGF1P05019 195 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 H1F0P07305 194 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SFTPBP07988 381 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NUDT17P0C025 328 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZCCHC18P0CG32 403 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PNMTP11086 282 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 KRT3P12035 628 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RARGP13631 454 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CKMT2P17540 419 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TNFAIP3P21580 790 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NT5EP21589 574 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ACHEP22303 614 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 HOXC9P31274 260 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ICAM3P32942 547 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PRKCIP41743 596 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PSMC4P43686 418 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RABIFP47224 123 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 HMGCS2P54868 508 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PRMT2P55345 433 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 BTG1P62324 171 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CSNK1G2P78368 415 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 IRX4P78413 519 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DEFA5Q01523 94 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CHRNDQ07001 517 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 KLRB1Q12918 225 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ART3Q13508 389 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NAE1Q13564 534 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ITPK1Q13572 414 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CAMK1Q14012 370 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TNIP1Q15025 636 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LY6EQ16553 131 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PTPROQ16827 1216 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LRRC26Q2I0M4 334 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DEFB113Q30KQ7 82 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 USP41Q3LFD5 358 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SP6Q3SY56 376 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LRRC24Q50LG9 513 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 EPC2Q52LR7 807 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SH2D4BQ5SQS7 431 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 BEND3Q5T5X7 828 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TTC22Q5TAA0 569 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 Q5XG85 94 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SIGIRRQ6IA17 410 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TCEAL6Q6IPX3 200 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ACAD10Q6JQN1 1059 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DLEU7Q6UYE1 221 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 KSR2Q6VAB6 950 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 C17orf107Q6ZR85 190 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 IL17RELQ6ZVW7 336 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 BBS12Q6ZW61 710 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF767PQ75MW2 155 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SPATA12Q7Z6I5 190 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RPAINQ86UA6 219 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NT5DC3Q86UY8 548 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CALHM3Q86XJ0 350 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CATSPERDQ86XM0 798 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CROCCP3Q8IVE0 287 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 UBALD2Q8IYN6 164 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 KIRREL3Q8IZU9 778 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SPICE1Q8N0Z3 855 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LIX1Q8N485 282 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PNKDQ8N490 385 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RNF182Q8N6D2 247 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LINC00337Q8N6G1 96 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF525Q8N782 197 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 C4orf32Q8N8J7 132 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 BANPQ8N9N5 519 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DNAAF3Q8N9W5 541 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 C15orf53Q8NAA6 179 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms