RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 C17orf100A8MU93 164 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 MEI4A8MW99 385 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 HHLA1C9JL84 531 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 CETN3O15182 167 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 BEST1O76090 585 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 CISD3P0C7P0 127 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 TRIM49P0CI25 452 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 TRIM49CP0CI26 452 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 EPB41P11171 864 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 PFKFB1P16118 471 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 CD58P19256 250 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 HARS2P49590 506 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 GALNTL6Q49A17 601 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 SPOPLQ6IQ16 392 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 TUBA1AQ71U36 451 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 MINDY1Q8N5J2 469 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 DEFB119Q8N690 84 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 FRMD1Q8N878 549 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 SCAIQ8N9R8 606 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 ANKRD52Q8NB46 1076 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 CADM4Q8NFZ8 388 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 DDI1Q8WTU0 396 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 RNF139Q8WU17 664 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 EID2BQ96D98 161 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 SIPA1Q96FS4 1042 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 ACOX2Q99424 681 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 TSG101Q99816 390 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 NUP58Q9BVL2 599 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 RMND1Q9NWS8 449 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 OSER1Q9NX31 292 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 RAB20Q9NX57 234 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 ELOVL2Q9NXB9 296 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-204ENST00000367379 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 STON1Q9Y6Q2 735 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 CEP192Q8TEP8 1941 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 ANTXRLA6NF34 631 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 WASH3PC4AMC7 463 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 TIMM23O14925 209 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-204ENST00000367379 CH25HO95992 272 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-204ENST00000367379 HMBSP08397 361 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 CFC1BP0CG36 223 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 CFC1P0CG37 223 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 PGFP49763 221 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 TKTL1P51854 596 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 NDUFA8P51970 172 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-204ENST00000367379 CETN1Q12798 172 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 SPARCL1Q14515 664 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 EDRF1Q3B7T1 1238 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 FUT11Q495W5 492 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 MPPE1Q53F39 396 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 C1orf220Q5T0J3 134 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 ARHGAP17Q68EM7 881 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-204ENST00000367379 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 UNC45BQ8IWX7 931 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-204ENST00000367379 CPXM2Q8N436 756 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 GOLGA1Q92805 767 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 SKA1Q96BD8 255 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 TWNKQ96RR1 684 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 GPR174Q9BXC1 333 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 NMUR1Q9HB89 426 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 CISHQ9NSE2 258 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-204ENST00000367379 ABCC13Q9NSE7 274 aa4.63□□□□□ -1.67
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