RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 USP7Q93009 1102 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 CCDC126Q96EE4 140 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 PIGVQ9NUD9 493 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 RDH8Q9NYR8 311 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 AP2A2O94973 939 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 HTR1EP28566 365 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SOX3P41225 446 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 PPP3CCP48454 512 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 HTR6P50406 440 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 PGBD5Q8N414 524 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 OR2T11Q8NH01 316 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 DDIT4Q9NX09 232 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ALG5Q9Y673 324 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 A0A0B4J293 547 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 TULP3O75386 442 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 PROS1P07225 676 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 PWP1Q13610 501 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 XKR4Q5GH76 650 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 LIPIQ6XZB0 460 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ISCA2Q86U28 154 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 MYLPFQ96A32 169 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 RNF31Q96EP0 1072 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SMOQ99835 787 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 KIFC1Q9BW19 673 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 GON7Q9BXV9 100 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 DUSP16Q9BY84 665 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 C12orf10Q9HB07 376 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZNF639Q9UID6 485 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 POM121CA8CG34 1229 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 TLR5O60602 858 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 KCNJ13O60928 360 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 C1QCP02747 245 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 GRIK1P39086 918 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 HCAR3P49019 387 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ARHGDIBP52566 201 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SCN1BQ07699 218 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 VEPH1Q14D04 833 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SNAPC1Q16533 368 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 UPP1Q16831 310 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 LHX8Q68G74 356 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ASB15Q8WXK1 588 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZNF583Q96ND8 569 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 RNF208Q9H0X6 261 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 FZD10Q9ULW2 581 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 FABP12A6NFH5 140 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SYPP08247 313 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 HERVK_113P63132 956 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 EMX2Q04743 252 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ASPNQ9BXN1 380 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SLC22A4Q9H015 551 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 DUSP21Q9H596 190 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SPATA2Q9UM82 520 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 TRIM77I1YAP6 450 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC13-201ENST00000366661 SYN3O14994 580 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms