RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366607.4

TOMM20-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM20, Length 3,387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20-201ENST00000366607 IMPAD1Q9NX62 359 aa11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 RHCGQ9UBD6 479 aa11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ITGAMP11215 1152 aa11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 HLA-DPA1P20036 260 aa11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 KCNQ1P51787 676 aa11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF605Q86T29 641 aa11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 SLC38A6Q8IZM9 456 aa11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ST6GAL2Q96JF0 529 aa11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 CCM2Q9BSQ5 444 aa11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa11.11□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 CLDN24A6NM45 220 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 H3BQ06 376 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ALPIP09923 528 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 RHOQP17081 205 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 OGNP20774 298 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 SOX3P41225 446 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 RPS14P62263 151 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ELP6Q0PNE2 266 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 CDK10Q15131 360 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 C16orf59Q7L2K0 433 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 C11orf74Q86VG3 221 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC115Q96NT0 180 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 MS4A12Q9NXJ0 267 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 MEIOCA2RUB1 952 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 CLIC1O00299 241 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 AKR7A2O43488 359 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 SCO1O75880 301 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 SNX4O95219 450 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 IGLV3-25P01717 112 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 IL6P05231 212 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ODC1P11926 461 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 FPR1P21462 350 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 SOX6P35712 828 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 RGS6P49758 472 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF45Q02386 682 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 GRB14Q14449 540 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 SDE2Q6IQ49 451 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF280BQ86YH2 543 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 LAX1Q8IWV1 398 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 UBQLNLQ8IYU4 475 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 SERPINB11Q96P15 392 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 IL1RAPQ9NPH3 570 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ERVH48-1M5A8F1 160 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 TAPBPO15533 448 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 RETP07949 1114 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ADORA3P0DMS8 318 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 CBLP22681 906 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 IFNA8P32881 189 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 FEN1P39748 380 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 UGT2B15P54855 530 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 CDH12P55289 794 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 TUBA1BP68363 451 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 IL18R1Q13478 541 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 TUBA1AQ71U36 451 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 SLC5A8Q8N695 610 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 KBTBD8Q8NFY9 601 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 OR9Q2Q8NGE9 314 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 ABCB8Q9NUT2 735 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 PPT2Q9UMR5 302 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 CARD8Q9Y2G2 431 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa11.1□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 A0A0G2JMZ2 1700 aa11.09□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 LRRC37A2A6NM11 1700 aa11.09□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa11.09□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 A0A1W2PQ09 198 aa11.09□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 C12orf71A8MTZ7 269 aa11.09□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 WDR47O94967 919 aa11.09□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
TOMM20-201ENST00000366607 KDELR2P33947 212 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms