RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365528.1

RNU6-61P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 61, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-61P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-61P-201ENST00000365528 VTNP04004 478 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 ATP1B1P05026 303 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SERPING1P05155 500 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 PDGFRAP16234 1089 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 DPEP1P16444 411 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 PSMA3P25788 255 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 NPY4RP50391 375 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 CLDN15P56746 228 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SGCGQ13326 291 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 TRIM29Q14134 588 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 ZNF273Q14593 569 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 PSMD6Q15008 389 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 RBBP7Q16576 425 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 TRIM65Q6PJ69 517 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 AMIGO1Q86WK6 493 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 CCDC63Q8NA47 563 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 Q8NFD4 153 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SETD6Q8TBK2 473 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 GATAD1Q8WUU5 269 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 PIK3R3Q92569 461 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 PYCR2Q96C36 320 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 GBP5Q96PP8 586 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SPAG5Q96R06 1193 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 IWS1Q96ST2 819 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 KRT12Q99456 494 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 FERMT1Q9BQL6 677 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 PIGQQ9BRB3 760 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SYT11Q9BT88 431 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SDCBP2Q9H190 292 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 ACTL8Q9H568 366 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 RNF121Q9H920 327 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 PKD2L2Q9NZM6 624 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SNX7Q9UNH6 387 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 A0A0J9YWU9 116 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 A0A1B0GU03 582 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 ANTXRLA6NF34 631 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 H7C423 109 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 TRIM49P0CI25 452 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 TRIM49CP0CI26 452 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 EPORP19235 508 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 CYP2A7P20853 494 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SFTPDP35247 375 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 TSFMP43897 325 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 CRKLP46109 303 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 RGS7P49802 495 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 CAPZA1P52907 286 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 XGP55808 180 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 GUCY2DQ02846 1103 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 CACNG1Q06432 222 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 CDH18Q13634 790 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 TMEM132DQ14C87 1099 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 PTPN14Q15678 1187 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 C6orf136Q5SQH8 315 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 FAAP20Q6NZ36 180 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 FBXL22Q6P050 247 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 MOXD1Q6UVY6 613 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 IL27RAQ6UWB1 636 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 Q6ZRP5 223 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 IL17RELQ6ZVW7 336 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SLC24A5Q71RS6 500 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 FCRLAQ7L513 359 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 CHMP1BQ7LBR1 199 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SPATA21Q7Z572 469 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 NRARPQ7Z6K4 114 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 LRRTM1Q86UE6 522 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 NME8Q8N427 588 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 ZNF519Q8TB69 540 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 ZNRF4Q8WWF5 429 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SEPT1Q8WYJ6 367 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 NSMAFQ92636 917 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SLCO2A1Q92959 643 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 C18orf12Q96KH6 178 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 AGAP3Q96P47 875 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 KLHL5Q96PQ7 755 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 BTBD9Q96Q07 612 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 MGME1Q9BQP7 344 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 TRIM15Q9C019 465 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 EGLN1Q9GZT9 426 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 PANK4Q9NVE7 773 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 GIMAP2Q9UG22 337 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 PRSS21Q9Y6M0 314 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 RNF215Q9Y6U7 377 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-61P-201ENST00000365528 SNED1Q8TER0 1413 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-61P-201ENST00000365528 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-61P-201ENST00000365528 C2CD4DB7Z1M9 353 aa2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms