RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361909.8

CMTM3-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-201ENST00000361909 ARTNQ5T4W7 220 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 LETMD1Q6P1Q0 360 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 SYCE2Q6PIF2 218 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 TBCDQ9BTW9 1192 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 GABARAPL3Q9BY60 117 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 DPY30Q9C005 99 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 CLMPQ9H6B4 373 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 C3orf14Q9HBI5 128 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 NDFIP2Q9NV92 336 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 CD274Q9NZQ7 290 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 IKZF3Q9UKT9 509 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 MED16Q9Y2X0 877 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 YIPF1Q9Y548 306 aa18.49■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 A0A096LPI6 279 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 RGS14O43566 566 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 IGLV3-27P01718 113 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 M6PRP20645 277 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 HOXA9P31269 272 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 VEPH1Q14D04 833 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 YIF1BQ5BJH7 314 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 CACHD1Q5VU97 1274 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 FAHD1Q6P587 224 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 AFTPHQ6ULP2 937 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 C7orf61Q8IZ16 206 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 NLGN4XQ8N0W4 816 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 PSD4Q8NDX1 1056 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 NETO1Q8TDF5 533 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 HCAR2Q8TDS4 363 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 CRELD1Q96HD1 420 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 ITCHQ96J02 903 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 PHOX2BQ99453 314 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 SLC30A2Q9BRI3 323 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 KCTD3Q9Y597 815 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 TLR5O60602 858 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 SLITRK5O94991 958 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 OTCP00480 354 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 CDK1P06493 297 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 PXNP49023 591 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 GALK2Q01415 458 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 FCHO2Q0JRZ9 810 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 TTLL9Q3SXZ7 439 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 CARD16Q5EG05 197 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 RMDN1Q96DB5 314 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 HRASLS5Q96KN8 279 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 CEP19Q96LK0 163 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 RHNO1Q9BSD3 238 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 KCNH6Q9H252 994 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 SP110Q9HB58 689 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 DYRK4Q9NR20 520 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 ADPRHL2Q9NX46 363 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 RPS6KA6Q9UK32 745 aa18.48■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 SLC28A1O00337 649 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 TEX28O15482 410 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 PKLRP30613 574 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 IL1RL1Q01638 556 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 NPRL3Q12980 569 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 XKRXQ6PP77 449 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 GCNT7Q6ZNI0 430 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 SPATC1Q76KD6 591 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 CEP68Q76N32 757 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 GATAD2AQ86YP4 633 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 FAM9CQ8IZT9 166 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 OR52B6Q8NGF0 335 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 ARRDC2Q8TBH0 407 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 APH1BQ8WW43 257 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 COL21A1Q96P44 957 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 OR2A14Q96R47 310 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 ARPC5LQ9BPX5 153 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 STMN3Q9NZ72 180 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 HS3ST4Q9Y661 456 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 COMMD10Q9Y6G5 202 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 ZNF840PA6NDX5 716 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 PRRG1O14668 218 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 TBX18O95935 607 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 NUDT1P36639 197 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 HTR6P50406 440 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 IL2P60568 153 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 GALNT3Q14435 633 aa18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CMTM3-201ENST00000361909 ENTHD1Q8IYW4 607 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms