RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 GPRC6AQ5T6X5 926 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 NCEH1Q6PIU2 408 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 CXCL17Q6UXB2 119 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 CMTM7Q96FZ5 175 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 Q96MT0 163 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 PDZK1P1A8MUH7 402 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 ZW10O43264 779 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 ADORA3P0DMS8 318 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 EPORP19235 508 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 PRPH2P23942 346 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 SOX6P35712 828 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 RGS6P49758 472 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 OLR1P78380 273 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 MTAPQ13126 283 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 IQCCQ4KMZ1 466 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 CTXN3Q4LDR2 81 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 NEK5Q6P3R8 708 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF621Q6ZSS3 439 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 C7orf34Q96L11 122 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 COL21A1Q96P44 957 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 CENPOQ9BU64 300 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 RUBCNLQ9H714 662 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 ASB8Q9H765 288 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa17.78■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 ANKRD34BA5PLL1 514 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 MAGEB17A8MXT2 336 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 ANXA5P08758 320 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 COL6A1P12109 1028 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 CTPS1P17812 591 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 ARPP19P56211 112 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 ARMCX4Q5H9R4 360 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 GNASQ5JWF2 1037 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF544Q6NX49 715 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 SPATC1Q76KD6 591 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 NLGN4XQ8N0W4 816 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 PIK3R3Q92569 461 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 TP53INP1Q96A56 240 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 APOLD1Q96LR9 279 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 RAD9AQ99638 391 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 TTPALQ9BTX7 342 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 SLC32A1Q9H598 525 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 FBXL12Q9NXK8 326 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 GPR83Q9NYM4 423 aa17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
LRRC25-201ENST00000339007 NBNO60934 754 aa17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 PRPS1L1P21108 318 aa17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 OR1G1P47890 313 aa17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 LIMK1P53667 647 aa17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 OR2B6P58173 313 aa17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 NFATC2Q13469 925 aa17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 VEZF1Q14119 521 aa17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 LINGO4Q6UY18 593 aa17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 STX19Q8N4C7 294 aa17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 CPA6Q8N4T0 437 aa17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 APIPQ96GX9 242 aa17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 DNTTP04053 509 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 STSP08842 583 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 ALPIP09923 528 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 ITGALP20701 1170 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 RRM2P31350 389 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 CA5AP35218 305 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 PXNP49023 591 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 NUDT6P53370 316 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 PAF1Q8N7H5 531 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 OR6F1Q8NGZ6 308 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 ABCG8Q9H221 673 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 PLK4O00444 970 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 INPPL1O15357 1258 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 AOC2O75106 756 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 PTHP01270 115 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 SLC15A1P46059 708 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 ARF5P84085 180 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 GGTA1PQ4G0N0 100 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 GLB1LQ6UWU2 654 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF605Q86T29 641 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC190Q86UF4 302 aa17.76■□□□□ 0.43
LRRC25-201ENST00000339007 FAM124AQ86V42 546 aa17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms