RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 APOL3O95236 402 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ADAM15Q13444 863 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 BTBD16Q32M84 506 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 C14orf80Q86SX3 495 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ELMOD2Q8IZ81 293 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 FATE1Q969F0 183 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 RDH12Q96NR8 316 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 GAL3ST1Q99999 423 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 BRINP2Q9C0B6 783 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 HAS3O00219 553 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 SERPINA3P01011 423 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ASGR1P07306 291 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 UNC50Q53HI1 259 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 FUT10Q6P4F1 479 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 SNX20Q7Z614 316 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 PARGQ86W56 976 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 TMC8Q8IU68 726 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF563Q8TA94 476 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 FUZQ9BT04 418 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM106CQ9BVX2 250 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 FXYD6Q9H0Q3 95 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 MARK1Q9P0L2 795 aa18.18■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 C8GP07360 202 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 AMD1P17707 334 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 SPATS1Q496A3 300 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 FAM110BQ8TC76 370 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ZSWIM3Q96MP5 696 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 TBX5Q99593 518 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 CCSER2Q9H7U1 834 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 DLGAP1O14490 977 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 DNASE1L1P49184 302 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 KCNQ1P51787 676 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 CAMK1Q14012 370 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 SORT1Q99523 831 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 SPATA7Q9P0W8 599 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 DBIP07108 87 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 KCNE1P15382 129 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 RYKP34925 604 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 CLK3P49761 638 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 PRR5P85299 388 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 EMX2Q04743 252 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 RTP4Q96DX8 246 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 SLC29A1Q99808 456 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 IFT27Q9BW83 186 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 MND1Q9BWT6 205 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 CDADC1Q9BWV3 514 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 CHP2O43745 196 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 HLA-DPB1P04440 258 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 CTSEP14091 401 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 PROZP22891 400 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 PTGR1Q14914 329 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 C6orf141Q5SZD1 244 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 SLC30A6Q6NXT4 461 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 XKRXQ6PP77 449 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 SCML4Q8N228 414 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 NEK7Q8TDX7 302 aa18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 PIRO00625 290 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ABHD18Q0P651 414 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 PNPLA1Q8N8W4 532 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ITPKCQ96DU7 683 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM39AQ9NV64 488 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 FAIMQ9NVQ4 179 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 RNF11Q9Y3C5 154 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 H7C2Y5 167 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 DNAJB5O75953 348 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 RBM34P42696 430 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF33AQ06730 810 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 B3GNT9Q6UX72 402 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 OR5AK3PQ8NH89 298 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 LRCH3Q96II8 777 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 SLC22A14Q9Y267 594 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 MTX2O75431 263 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 HMGN1P05114 100 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 CD2P06729 351 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 SF1Q15637 639 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 CTC1Q2NKJ3 1217 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 QSOX2Q6ZRP7 698 aa18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PRKCI-201ENST00000295797 ASB12Q8WXK4 309 aa18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms