RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-201ENST00000280780 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.49■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa21.49■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 GSAPA4D1B5 854 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 TRABD2BA6NFA1 517 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 ISM1B1AKI9 464 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 EBAG9O00559 213 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 CSO75390 466 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 CSF2RBP32927 897 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 LSSP48449 732 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 LCP2Q13094 533 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 KIR2DS3Q14952 304 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 ISXQ2M1V0 245 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 ICE2Q659A1 982 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 TRIM73Q86UV7 250 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 OR2L3Q8NG85 312 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 CDK15Q96Q40 435 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 MIPEPQ99797 713 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 NUDT22Q9BRQ3 303 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 PMS2P1A4D2B8 440 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 AMD1P17707 334 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 SH3BP2P78314 561 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 SPIDRQ14159 915 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 RBBP7Q16576 425 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 CATSPEREQ5SY80 951 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 SYVN1Q86TM6 617 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 AGAP11Q8TF27 550 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 C10orf82Q8WW14 230 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 PCBD2Q9H0N5 130 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 SLC6A20Q9NP91 592 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 TMEM9Q9P0T7 183 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 POMT2Q9UKY4 750 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 ZZEF1O43149 2961 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 TPRP12270 2363 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 C2orf74A8MZ97 194 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 AGRPO00253 132 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 NRP2O60462 931 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 CAPNS1P04632 268 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 CD22P20273 847 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 PIK3CGP48736 1102 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 GFERP55789 205 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 ERVPABLB-1P60509 514 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 LETMD1Q6P1Q0 360 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 SPESP1Q6UW49 350 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 SLC5A11Q8WWX8 675 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF382Q96SR6 550 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 SIKE1Q9BRV8 207 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 HAUS8Q9BT25 410 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 TRMOQ9BU70 441 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 SEMA6CQ9H3T2 930 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 GPRC5BQ9NZH0 403 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 KLHL20Q9Y2M5 609 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 KCNE2Q9Y6J6 123 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 D6RAR5 112 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 CDH1P12830 882 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 MPSTP25325 297 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 VARSP26640 1264 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 NAA20P61599 178 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 GPLD1P80108 840 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 PCDH1Q08174 1060 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 SF1Q15637 639 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 KLHL35Q6PF15 583 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 TMPRSS11BQ86T26 416 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 CUZD1Q86UP6 607 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 SPNS1Q9H2V7 528 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 NPHS2Q9NP85 383 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 MID1IP1Q9NPA3 183 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 DYRK1BQ9Y463 629 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 ACACBO00763 2458 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM53B-201ENST00000280780 KATNA1O75449 491 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 WFS1O76024 890 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 HSPA4LO95757 839 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 MLYCDO95822 493 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 GNAZP19086 355 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CCNG1P51959 295 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 PRKAA1Q13131 559 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 E2F2Q14209 437 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 C17orf64Q86WR6 236 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 OR4F6Q8NGB9 312 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 NCSTNQ92542 709 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 SLC22A18Q96BI1 424 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 DEPDC7Q96QD5 511 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 KCNA7Q96RP8 456 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 NTMT1Q9BV86 223 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms