RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 BAK1Q16611 211 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 GDPD1Q8N9F7 314 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 CDC26Q8NHZ8 85 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 FOPNLQ96NB1 174 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 DYRK4Q9NR20 520 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 COPS3Q9UNS2 423 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 VWA8A3KMH1 1905 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 A0A1B0GVM2 712 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PQ09 198 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 SLC12A8A0AV02 714 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 IGLV3-25P01717 112 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 F7P08709 466 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 KCNC1P48547 511 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 GPR15P49685 360 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 MAB21L1Q13394 359 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 NFYCQ13952 458 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD34AQ69YU3 496 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 CYHR1Q6ZMK1 362 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 SCD5Q86SK9 330 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 NMUR1Q9HB89 426 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 GLS2Q9UI32 602 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.28■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 TSC22D2O75157 780 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 ERN1O75460 977 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 PDE9AO76083 593 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 RPS17P08708 135 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 SLC2A3P11169 496 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 ZP3P21754 424 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 OLIG2Q13516 323 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 QPRTQ15274 297 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 TFAP2EQ6VUC0 442 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 HS3ST5Q8IZT8 346 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 ITFG1Q8TB96 612 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 TSPEARQ8WU66 669 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 GPR78Q96P69 363 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 C12orf57Q99622 126 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 GHITMQ9H3K2 345 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 SLC52A3Q9NQ40 469 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 EMC3Q9P0I2 261 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 FBXO10Q9UK96 956 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 MAPRE3Q9UPY8 281 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 FKBP7Q9Y680 259 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 FAM20BO75063 409 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 KDM4DQ6B0I6 523 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 RIT1Q92963 219 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 V9GYH0 126 aa21.27■■□□□ 1
PITX1-201ENST00000265340 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 OAZ2O95190 189 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 CSF2RAP15509 400 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 SOX11P35716 441 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 GPR19Q15760 415 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 SPESP1Q6UW49 350 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 NLRP8Q86W28 1048 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 ABI1Q8IZP0 508 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 FRS2Q8WU20 508 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 RNF34Q969K3 372 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 Q96MT0 163 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 OMDQ99983 421 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 RHNO1Q9BSD3 238 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 SHARPINQ9H0F6 387 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 OSER1Q9NX31 292 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 ACSL5Q9ULC5 683 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 ERVW-1Q9UQF0 538 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 GMDSO60547 372 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 RAB25P57735 213 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 KEAP1Q14145 624 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 POU4F3Q15319 338 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 GPR139Q6DWJ6 353 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 GALNT10Q86SR1 603 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 TMEM135Q86UB9 458 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 VWCEQ96DN2 955 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 SEC22CQ9BRL7 303 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 NEU3Q9UQ49 428 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 ACOT9Q9Y305 439 aa21.26■□□□□ 0.99
PITX1-201ENST00000265340 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms