RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263966.7

USP13-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP13, Length 8,323 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-201ENST00000263966 DPP6P42658 865 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 CBLBQ13191 982 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 BBS12Q6ZW61 710 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 GAB3Q8WWW8 586 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 ESPL1Q14674 2120 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 ANGPTL1O95841 491 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 SMSP52788 366 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 CDH12P55289 794 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 RAB31Q13636 194 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 SEMA3AQ14563 771 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 ZNF550Q7Z398 422 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 ANKRA2Q9H9E1 313 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 ZNF224Q9NZL3 707 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 CLDN25C9JDP6 229 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 BRINP1O60477 761 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 AP2A1O95782 977 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 RCN3Q96D15 328 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 OR1F2PQ96R84 312 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 MATN3O15232 486 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 TPSB2P20231 275 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 GSTM2P28161 218 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 TPSAB1Q15661 275 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 SPRYD7Q5W111 196 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 ERI3O43414 337 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 NADKO95544 446 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 PEPDP12955 493 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 VMACQ2NL98 169 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 INPPL1O15357 1258 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 CD63P08962 238 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 CYP2U1Q7Z449 544 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 SUV39H2Q9H5I1 410 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 NLGN3Q9NZ94 848 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 TLR6Q9Y2C9 796 aa16.09■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 KCNJ13O60928 360 aa16.08■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 TNFSF9P41273 254 aa16.08■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 CLEC1AQ8NC01 280 aa16.08■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 OR56A1Q8NGH5 318 aa16.08■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 SLC22A14Q9Y267 594 aa16.08■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 TELO2Q9Y4R8 837 aa16.08■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.08■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 ENTPD6O75354 484 aa16.08■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 E2F1Q01094 437 aa16.08■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 BPIFB1Q8TDL5 484 aa16.08■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 PTPRMP28827 1452 aa16.08■□□□□ 0.17
USP13-201ENST00000263966 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 OR5K4A6NMS3 321 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SAP18O00422 153 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 MBLAC2Q68D91 279 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 PAQR7Q86WK9 346 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 RCBTB1Q8NDN9 531 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 AGAP2Q99490 1192 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ZNF221Q9UK13 617 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SVILO95425 2214 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 BCL2A1Q16548 175 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 KCTD21Q4G0X4 260 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ZFP3Q96NJ6 502 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 DEFB126Q9BYW3 111 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 A0A087WUU8 490 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 DISC1C4P0D8 188 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SYN1P17600 705 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ADRA1BP35368 520 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 NPTX1Q15818 432 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 DEFB119Q8N690 84 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 OR8S1Q8NH09 359 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SCELO95171 688 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 CRHR1P34998 444 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 AHSA2Q719I0 299 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 RASGEF1CQ8N431 466 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 MAP3K3Q99759 626 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 OAZ2O95190 189 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 CBX6O95503 412 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 GNRHRP30968 328 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 GPR33Q49SQ1 333 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ABHD17BQ5VST6 288 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 RAET1LQ5VY80 246 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 TXN2Q99757 166 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SLC35A5Q9BS91 424 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms