RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261609.11

HERC2-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC2, Length 15,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-201ENST00000261609 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 DNASE1L2Q92874 299 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 CGREF1Q99674 301 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 CD300AQ9UGN4 299 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 CARNS1A5YM72 827 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SCAMP1O15126 338 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 MAGEA11P43364 429 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 A0A1W2PP18 115 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 FAM159BA6NKW6 160 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SRCP12931 536 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 KBTBD6Q86V97 674 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 C17orf64Q86WR6 236 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 MEN1O00255 615 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 TYROBPO43914 113 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 ATG13O75143 517 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 ARHGEF15O94989 841 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 DGKQP52824 942 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 NDST2P52849 883 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 NUDT6P53370 316 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 PNLIPRP1P54315 467 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 FCER2P06734 321 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 C2orf80Q0P641 193 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 PCM1Q15154 2024 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SCN2BO60939 215 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 NPPAP01160 153 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 KCNJ11Q14654 390 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 DERAQ9Y315 318 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 ASGR1P07306 291 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 ATE1O95260 518 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 T-ENOLP0DO92 83 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 MC2RQ01718 297 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 MSS51Q4VC12 460 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 BORAQ6PGQ7 559 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 BEST3Q8N1M1 668 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 OSTF1Q92882 214 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 POLHQ9Y253 713 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 CPQQ9Y646 472 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 ZNF35P13682 527 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SREBF2Q12772 1141 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 FGFBP1Q14512 234 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 UGCGQ16739 394 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 ZFP90Q8TF47 636 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 TM9SF2Q99805 663 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 OR10A4Q9H209 315 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 GNALP38405 381 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 C3P1Q6ZMU1 363 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 ARL5BQ96KC2 179 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SMOXQ9NWM0 555 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SSX4O60224 188 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 GLUD2P49448 558 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 VAMP2P63027 116 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SPACA7Q96KW9 195 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 ZNF358Q9NW07 568 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC2-201ENST00000261609 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms