RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 BNIP3Q12983 259 aa16.05■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 GRIK2Q13002 908 aa16.05■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 GKN2Q86XP6 184 aa16.05■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 PYROXD2Q8N2H3 581 aa16.05■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 OR10A4Q9H209 315 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 HTR3EA5X5Y0 456 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 ADAMTS3O15072 1205 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 SPIN4Q56A73 249 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 C7orf57Q8NEG2 295 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 COL21A1Q96P44 957 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 NMUR2Q9GZQ4 415 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 ENTPD6O75354 484 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 DECR1Q16698 335 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 LRRTM4Q86VH4 590 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 ROPN1LQ96C74 230 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 FAM227AF5H4B4 570 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 JUNP05412 331 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 SMSP52788 366 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 CD83Q01151 205 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 FPGSQ05932 587 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 COQ8AQ8NI60 647 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 C16orf58Q96GQ5 468 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 LILRA4P59901 499 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 PAMR1Q6UXH9 720 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 THRSPQ92748 146 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 DPEP3Q9H4B8 488 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 GRHPRQ9UBQ7 328 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 LGR5O75473 907 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 IDH3AP50213 366 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 C12orf40Q86WS4 652 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 CD180Q99467 661 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 ABCG2Q9UNQ0 655 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 CH25HO95992 272 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 PLP2Q04941 152 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 ARL9Q6T311 187 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 OR6N1Q8NGY5 312 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 OR5J2Q8NH18 312 aa16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 AXIN1O15169 862 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 BCHEP06276 602 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 E2F1Q01094 437 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 CRHR2Q13324 411 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 SYCE2Q6PIF2 218 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 MFSD2AQ8NA29 543 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 LPIN3Q9BQK8 851 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 ATPIF1Q9UII2 106 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 CYP2S1Q96SQ9 504 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 GPR20Q99678 358 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 ERI3O43414 337 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 PDYNP01213 254 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 MSL3P1P0C860 447 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 PAOXQ6QHF9 649 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 KCTD9Q7L273 389 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 BTBD19C9JJ37 291 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 SCELO95171 688 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 RHEBQ15382 184 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 OR4C15Q8NGM1 316 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 MAFIPQ8WZ33 124 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 PKP4Q99569 1192 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 GNAO1P09471 354 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 PLEKHG6Q3KR16 790 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM225Q6GV28 225 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 ABHD15Q6UXT9 468 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 SLC51AQ86UW1 340 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 TYRP1P17643 537 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 FCGR1BQ92637 280 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.03■□□□□ 0.16
LAMC1-201ENST00000258341 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms