RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 KLK8O60259 260 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 GOT2P00505 430 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT1P04628 370 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CFIP05156 583 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 LHCGRP22888 699 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CES1P23141 567 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 STC1P52823 247 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN2P57739 230 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 GABARAPL2P60520 117 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS21P63220 83 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 DAG1Q14118 895 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 NANOGP8Q6NSW7 305 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 NIPAL1Q6NVV3 410 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 NEK5Q6P3R8 708 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 LPCAT1Q8NF37 534 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 BRSK1Q8TDC3 778 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TBATAQ96M53 351 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 NANOGQ9H9S0 305 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R13Q9NYV9 303 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ASPDHA6ND91 283 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SUPT3HB4E1H0 165 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 GDF9O60383 454 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SUPT3HO75486 399 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RAP2AP10114 183 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 GSTM2P28161 218 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 HNF1BP35680 557 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ARSFP54793 590 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RABL3Q5HYI8 236 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA2013Q8IYS2 634 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4L1Q8NH43 312 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 BLOC1S6Q9UL45 172 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF711Q9Y462 761 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PIRTP0C851 137 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRM3P20309 590 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 DIO3P55073 304 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 BNC1Q01954 994 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNC4Q03721 635 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 TGFBIQ15582 683 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 NEDD8Q15843 81 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM52BQ4KMG9 183 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 THAP5Q7Z6K1 395 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNEQ86WN2 208 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2I1PQ8NGU4 316 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 SCRN2Q96FV2 425 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ING2Q9H160 280 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 GIMAP2Q9UG22 337 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP6CO00743 305 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V1G1O75348 118 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CLIC3O95833 236 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF806P0C7X5 589 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 C6P13671 934 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 RELAQ04206 551 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKG2Q13237 762 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ERAP2Q6P179 960 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 LIPIQ6XZB0 460 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 RFLNAQ6ZTI6 216 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CXorf40AQ8TE69 158 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNA7Q96RP8 456 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 BTRCQ9Y297 605 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 GMNNO75496 209 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CLPXO76031 633 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBC1P01850 177 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 THRBP10828 461 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CD9P21926 228 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 BMXP51813 675 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ELP6Q0PNE2 266 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 PAGE3Q5JUK9 113 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFAND4Q86XD8 727 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 OR56A4Q8NGH8 313 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 SDCCAG3Q96C92 435 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF145Q96MT1 663 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPN10Q9HC96 672 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 BPTFQ12830 3046 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 LNP1A1A4G5 178 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC162PA2VCL2 907 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 FUOMA2VDF0 154 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BMM5 538 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 SULT1C4O75897 302 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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