RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 HNMTP50135 292 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB8P50452 374 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 PRTGQ2VWP7 1150 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CDKL4Q5MAI5 379 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 GPSM1Q86YR5 675 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ABHD11Q8NFV4 315 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 OR4K1Q8NGD4 311 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CLIP3Q96DZ5 547 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SLC45A3Q96JT2 553 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 GBP5Q96PP8 586 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 TMEM79Q9BSE2 394 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CHST8Q9H2A9 424 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ALG9Q9H6U8 611 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 NMRAL1Q9HBL8 299 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A14Q9Y267 594 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 KLHL2O95198 593 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CDH1P12830 882 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 MTHFD2P13995 350 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 EZRP15311 586 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 TCN2P20062 427 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ITGAXP20702 1163 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 HRH2P25021 359 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 TCTE1Q5JU00 501 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 C17orf64Q86WR6 236 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 DTWD1Q8N5C7 304 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 PDPRQ8NCN5 879 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 EGFL8Q99944 293 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 HAUS8Q9BT25 410 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ZNF358Q9NW07 568 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 FETUBQ9UGM5 382 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ATMQ13315 3056 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 TRIM49D1C9J1S8 452 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 RFPL1O75677 317 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 KRT38O76015 456 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SHBGP04278 402 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 HBQ1P09105 142 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CNTFP26441 200 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 DNASE1L3Q13609 305 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 FBXO48Q5FWF7 155 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CATSPEREQ5SY80 951 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 WDR93Q6P2C0 686 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 FAM198BQ6UWH4 519 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 TIFABQ6ZNK6 161 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 FRA10AC1Q70Z53 315 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 STAG3L4Q8TBR4 150 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 MR1Q95460 341 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 NEIL2Q969S2 332 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ESAMQ96AP7 390 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A11Q9NSA0 550 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 TLK1Q9UKI8 766 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 RNF112Q9ULX5 631 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 LHX6Q9UPM6 363 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 IKBKGQ9Y6K9 419 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CCDC88CQ9P219 2028 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 NKX2-8O15522 239 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 KERAO60938 352 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CYP4F2P78329 520 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 GRM7Q14831 915 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 C1orf189Q5VU69 101 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SULT1C3Q6IMI6 304 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 GPR155Q7Z3F1 870 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 VN1R4Q7Z5H5 301 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ADCK2Q7Z695 626 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 RHEBL1Q8TAI7 183 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 MZB1Q8WU39 189 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SARGQ9BW04 601 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SPNS1Q9H2V7 528 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CUTCQ9NTM9 273 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SRPK3Q9UPE1 567 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ASB1Q9Y576 335 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 FEZF1A0PJY2 475 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 C21orf140B9A014 251 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 P2RX6O15547 441 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF4O60810 478 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ONECUT2O95948 504 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 BCL6P41182 706 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 ACAP2Q15057 778 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 FAM83EQ2M2I3 478 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 HKDC1Q2TB90 917 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms