RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222402.7

UBE2D4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 D4 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2D4, Length 3,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4-201ENST00000222402 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 NLNQ9BYT8 704 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 SLC1A7O00341 560 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 RAPSNQ13702 412 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 CYP2A13Q16696 494 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 SYT16Q17RD7 645 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 PYCR3Q53H96 274 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 KCNC2Q96PR1 638 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 OR51B5Q9H339 312 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ACTL8Q9H568 366 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 H3BN98 237 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 LAMP1P11279 417 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ZNF30P17039 623 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 SERPINB1P30740 379 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 TMBIM6P55061 237 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 VRK3Q8IV63 474 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 IRF7Q92985 503 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 SCN4AP35499 1836 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 KLHL33A6NCF5 533 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 CLDN25C9JDP6 229 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 E7EQ34 232 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 CDKN2CP42773 168 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 RXRGP48443 463 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 DAB2P98082 770 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 CAP1Q01518 475 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 SP140Q13342 867 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ZNF846Q147U1 533 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 SELENONQ9NZV5 590 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 RFPL2O75678 378 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 CLPXO76031 633 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 INMTO95050 263 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 MAP2K4P45985 399 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 TUBA3CQ13748 450 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 RRM2BQ7LG56 351 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 FNDC8Q8TC99 324 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 COQ6Q9Y2Z9 468 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 TTC34A8MYJ7 566 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 RGS5O15539 181 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 CSF2RAP15509 400 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 LHCGRP22888 699 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 CRHBPP24387 322 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 AOAHP28039 575 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 PLA2G16P53816 162 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 PTSQ03393 145 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 MOGQ16653 247 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 SMU1Q2TAY7 513 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 GPR149Q86SP6 731 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ASB11Q8WXH4 323 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 MAL2Q969L2 176 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 VPS35Q96QK1 796 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 KNL1Q8NG31 2342 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 SLC16A8O95907 504 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 GNRH1P01148 92 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 MPC1LP0DKB6 136 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 PTPN2P17706 415 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 MATN1P21941 496 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 PIGAP37287 484 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 HTR3DQ70Z44 454 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 SPARTQ8N0X7 666 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2D4-201ENST00000222402 DLGAP3O95886 979 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms