RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cmtm6Q9CZ69 183 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kctd14A0A0U1RNG7 287 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pole2O54956 527 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddx6P54823 483 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpt1aP97742 773 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm4951Q3UED7 406 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ephx3Q3V1F8 367 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1080Q7TR67 313 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slco4c1Q8BGD4 722 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tgif2Q8C0Y1 237 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vps37aQ8CHS8 397 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mmgt2Q8R3L0 123 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Agr3Q8R3W7 165 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nprl3Q8VIJ8 569 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uqcc2Q9CQY6 136 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 S100a14Q9D2Q8 104 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc6a14Q9JMA9 638 aa20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Malrd1A2AJX4 2123 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itih4A6X935 942 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DdcO88533 480 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HmbsP22907 361 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tdrd6P61407 2134 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc10a2P70172 348 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HpcaP84075 193 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Npy2rP97295 381 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pla2g5P97391 137 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bhlhb9Q6PB60 539 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hfe2Q7TQ32 420 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubp1Q811S7 540 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc38a9Q8BGD6 560 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Asrgl1Q8C0M9 326 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Strip2Q8C9H6 844 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tceal5Q8CCT4 200 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ZwilchQ8R060 589 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uhrf1Q8VDF2 782 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Faap100A2ACJ2 879 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TriqkB2B9E1 86 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dcpp3L7N259 170 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Capn5O08688 640 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bnc1O35914 961 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bard1O70445 765 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgap39P59281 1107 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cry1P97784 606 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif1adQ3THJ3 170 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdh7Q8BM92 785 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LdahQ8BVA5 326 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gucy1b2Q8BXH3 824 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map2k7Q8CE90 535 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgrg1Q8K209 687 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ManbaQ8K2I4 879 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BroxQ8K2Q7 411 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cops8Q8VBV7 209 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CacybpQ9CXW3 229 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Upk3aQ9JKX8 287 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hacl1Q9QXE0 581 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dpp6Q9Z218 804 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm29776A0A286YEC0 699 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm14781A2A9Q9 366 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm13088A2AGW6 460 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AccsA2AIG8 502 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd93O89103 644 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MndaP0DOV1 425 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdk18Q04899 451 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mageb5Q14AN0 366 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SctrQ5FWI2 447 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam149b1Q6NSV7 578 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mfsd13aQ6PDE8 519 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1322Q7TQW3 310 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1085Q7TR64 313 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map4k5Q8BPM2 847 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mlc1Q8VHK5 382 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nipal2Q91WC7 383 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp12Q9D9M2 370 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rgs1Q9JL25 209 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc25a13Q9QXX4 676 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc22a4Q9Z306 553 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm13283A0A087WPG5 182 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kpna3O35344 521 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Npc1O35604 1277 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spire1Q52KF3 598 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem151bQ68FE7 561 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1252Q7TQZ2 314 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr297Q7TS07 310 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Btnl1Q7TST0 509 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hsfy2Q80Y37 392 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prpf18Q8BM39 342 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 N4bp2l2Q8JZS6 575 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TmieQ8K467 153 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r215Q8R264 300 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Epm2aip1Q8VEH5 606 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kbtbd12Q9D618 625 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem240B2RWJ3 173 aa20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cped1B2RX70 1026 aa20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68 ms