RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ddx1Q91VR5 740 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dok4Q99KE3 325 aa6.86□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ergic3Q9CQE7 383 aa6.86□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nudt8Q9CR24 210 aa6.86□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mid2Q9QUS6 705 aa6.86□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rgs20Q9QZB1 239 aa6.86□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cldn7Q9Z261 211 aa6.86□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm28897A0A087WP44 222 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Igkv17-121A0A0G2JFA8 117 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 1700001O22RikA2APZ1 375 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pramef17A2ASJ1 475 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cyp2j8G3UZ38 503 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Bbip1J3QMK2 67 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm21738J3QP72 227 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r13L7N1X2 831 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r46L7N282 809 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc32a1O35633 525 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Htr5bP31387 370 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 HmgclP38060 325 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rps7P62082 194 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pou1f1Q00286 291 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Srek1ip1Q4V9W2 153 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc10a7Q5PT53 340 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lcn3Q62471 182 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dusp23Q6NT99 150 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Otop2Q80SX5 563 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc25a12Q8BH59 677 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Trmt2bQ8BQJ6 493 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem72Q8C3K5 275 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Colec10Q8CF98 277 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dcun1d3Q8K0V2 304 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr677Q8VF06 312 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr330Q8VGD9 315 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cers2Q924Z4 380 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 MtfmtQ9D799 386 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc22a17Q9D9E0 401 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fundc1Q9DB70 155 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Arr3Q9EQP6 381 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cngb3Q9JJZ9 694 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Trim3Q9R1R2 744 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm28961A0A087WPA5 222 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm21858A0A087WQ24 222 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Btbd35f21A0A140T8Q5 498 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Prrt4B2RU40 902 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 4930455H04RikD3Z622 58 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Akain1G3UWD5 69 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Btbd35f22J3QN64 498 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r102L7N279 857 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 FkbplO35450 347 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ifnar2O35664 513 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 P06324 132 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mcpt2P15119 244 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Acvr2aP27038 513 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Uba1yP31254 1058 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Csn1s2aQ02862 184 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Col28a1Q2UY11 1141 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vsx2Q61412 361 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nr0b2Q62227 260 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pwwp2aQ69Z61 730 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ccdc117Q6PB51 277 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Abhd10Q6PE15 297 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp606Q7TSV0 794 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gadl1Q80WP8 550 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hmgxb4Q80Y32 594 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 NfascQ810U3 1240 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zbtb46Q8BID6 600 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rgs8Q8BXT1 180 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Npsr1Q8BZP8 371 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nlrp10Q8CCN1 673 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Kctd20Q8CDD8 419 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 TbceQ8CIV8 524 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Snapc1Q8K0S9 389 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gulp1Q8K2A1 304 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rev1Q920Q2 1249 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nrif2Q921B4 824 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pwp1Q99LL5 501 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 St7Q99M96 577 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q9CWU4 180 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 S100a14Q9D2Q8 104 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmbim4Q9DA39 238 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tor3aQ9ER38 385 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Wfdc1Q9ESH5 211 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pole3Q9JKP7 145 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ehd3Q9QXY6 535 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slco1a1Q9QXZ6 670 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm3604A0A087WPN2 559 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn1r3A2AMT7 306 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r120E9PX34 856 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fam170bE9PXT9 378 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm20671F6TVX7 576 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r10K7N621 847 aa6.85□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ebf3O08791 596 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.1 ms