RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 NT5DC2Q9H857 520 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 IPPKQ9H8X2 491 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 Q9N2J8 555 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 CNTN3Q9P232 1028 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM64BA6NI03 449 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 SLC16A5O15375 505 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 CTDNEP1O95476 244 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 NTSR2O95665 410 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 HDCP19113 662 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 MMP8P22894 467 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 CXCR1P25024 350 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 SLC5A3P53794 718 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 GPX6P59796 221 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 MLC1Q15049 377 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 DECR1Q16698 335 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 MLIPQ5VWP3 458 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 SRRDQ9UH36 339 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 BLACEA4D250 179 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 AOC2O75106 756 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 IL7P13232 177 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 AGXTP21549 392 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 TGM4P49221 684 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 RNF148Q8N7C7 305 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 FAAHO00519 579 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 SLITRK3O94933 977 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 APBB3O95704 486 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 LATS1O95835 1130 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 IMPDH1P20839 514 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 CDH12P55289 794 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGAP8P85298 464 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 TRAM2Q15035 370 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 APOLD1Q96LR9 279 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 HAPLN3Q96S86 360 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
SCN2A-209ENST00000636071 HHLA1C9JL84 531 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 SLC2A5P22732 501 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ITPKAP23677 461 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CYP1B1Q16678 543 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 IL23RQ5VWK5 629 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CES3Q6UWW8 571 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TWNKQ96RR1 684 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CHST7Q9NS84 486 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TECPR2O15040 1411 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 DPPA5A6NC42 116 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 HCRTR2O43614 444 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 RFPL1O75677 317 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00032P0C843 101 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 IFNGR1P15260 489 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 PLP2Q04941 152 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TUSC3Q13454 348 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 RAB11BQ15907 218 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC58Q4VC31 144 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 RSC1A1Q92681 617 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 HDAC10Q969S8 669 aa6.21□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms