RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 NELL1Q92832 810 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 TWSG1Q9GZX9 223 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SPAG17Q6Q759 2223 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GTW7 788 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD65E5RJM6 399 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPB8E9PQR5 432 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR37L1O60883 481 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPH2P23942 346 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PRDX6P30041 224 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR18Q14330 331 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 GSTA3Q16772 222 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 IMPG1Q17R60 797 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 AP5B1Q2VPB7 878 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 LAS2Q8IYD9 372 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD11Q8NFV4 315 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4E2Q8NGC2 313 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SPNS1Q9H2V7 528 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 NCOR1O75376 2440 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GVT2 93 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PIPSLA2A3N6 862 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 EMX2Q04743 252 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXL6Q8N531 539 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 FNDC5Q8NAU1 212 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 REPS1Q96D71 796 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SRMSQ9H3Y6 488 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM74BQ9NUR3 256 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 AIG1Q9NVV5 245 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SPHK1Q9NYA1 384 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PILRBQ9UKJ0 227 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 YY2O15391 372 aa23.97■■□□□ 1.43
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CAPNS1-215ENST00000628018 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 IDO1P14902 403 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 GNSP15586 552 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 CD1EP15812 388 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 DIO3P55073 304 aa23.97■■□□□ 1.43
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CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4K1Q8NGD4 311 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 CMTM5Q96DZ9 223 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR45Q9Y5Y3 372 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 B4DGG1 531 aa23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-215ENST00000628018 HSD3B2P26439 372 aa23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-215ENST00000628018 STX1BP61266 288 aa23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2E3Q969T4 207 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf50Q9BV19 199 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 BRINP2Q9C0B6 783 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 BRF2Q9HAW0 419 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 LRTM1Q9HBL6 345 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf109Q9NX04 203 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 LMO7DNF2Z398 122 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 BTN3A3O00478 584 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PIAS2O75928 621 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PCNAP12004 261 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 CNR2P34972 360 aa23.95■■□□□ 1.43
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CAPNS1-215ENST00000628018 CCR8P51685 355 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ABATP80404 500 aa23.95■■□□□ 1.43
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CAPNS1-215ENST00000628018 HERC3Q15034 1050 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0040Q15053 153 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCL1Q15111 1095 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF19Q2TAC6 998 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ADNP2Q6IQ32 1131 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ASRGL1Q7L266 308 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFAND4Q86XD8 727 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT78Q8N1N4 520 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 POU5F2Q8N7G0 328 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF740Q8NDX6 193 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 HUS1BQ8NHY5 278 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
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