RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 PSPHP78330 225 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 DHCR24Q15392 516 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 DPYSL2Q16555 572 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NTRK2Q16620 822 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CDKAL1Q5VV42 579 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 GPR153Q6NV75 609 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ARL14Q8N4G2 192 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 LRRC58Q96CX6 371 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 OR14A2Q96R54 314 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 UNC93B1Q9H1C4 597 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 RNF19AQ9NV58 838 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TLL2Q9Y6L7 1015 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ADGBQ8N7X0 1667 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 A0A1W2PRB8 838 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM149AA5PLN7 773 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 A6NCN8 305 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 PCDH7O60245 1069 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SLITRK3O94933 977 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 DIRAS3O95661 229 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 JUNP05412 331 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 RAP2AP10114 183 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 RAC2P15153 192 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TACR2P21452 398 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 BMP8BP34820 402 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 FASLGP48023 281 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 DGKGP49619 791 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF81P51508 661 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 DGKEP52429 567 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 DSTNP60981 165 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 GALK2Q01415 458 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 COL28A1Q2UY09 1125 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 PLEKHG6Q3KR16 790 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC25A52Q3SY17 297 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 GLT8D1Q68CQ7 371 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 VSTM1Q6UX27 236 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC26A9Q7LBE3 791 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 LIX1LQ8IVB5 337 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZFPM1Q8IX07 1006 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 PM20D2Q8IYS1 436 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 KIAA0895Q8NCT3 520 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SHKBP1Q8TBC3 707 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC35C1Q96A29 364 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NUS1Q96E22 293 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 P2RY11Q96G91 374 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ALPK1Q96QP1 1244 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 STRADBQ9C0K7 418 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CTPS2Q9NRF8 586 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NCANO14594 1321 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 LCHNA4D1U4 455 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ARGFXA6NJG6 315 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 A8MUI8 341 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NPIPA3F8WFD2 350 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 M0R233 179 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 AIPO00170 330 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CLDN5O00501 218 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ANKRD28O15084 1053 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SCAMP1O15126 338 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CD36P16671 472 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 RHOQP17081 205 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 PTPN2P17706 415 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 HOXC8P31273 242 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MALLQ13021 153 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 RPA4Q13156 261 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.782e-6■■□□□ 13.4
ANKRD28-215ENST00000624145 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SYT16Q17RD7 645 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 UAP1L1Q3KQV9 507 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM119Q4V9L6 283 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 C3P1Q6ZMU1 363 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 OTOP1Q7RTM1 612 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 AMZ2Q86W34 360 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms