RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 PMP22Q01453 160 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 DR1Q01658 176 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 SLC29A2Q14542 456 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 NDUFA5Q16718 116 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 P3H1Q32P28 736 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 AGAP9Q5VTM2 703 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 MLIPQ5VWP3 458 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 LRRC66Q68CR7 880 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 TMEM53Q6P2H8 277 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 ERP27Q96DN0 273 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 SCRN2Q96FV2 425 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 HES6Q96HZ4 224 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 BIRC8Q96P09 236 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 SIKE1Q9BRV8 207 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 PPCSQ9HAB8 311 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 PLGRKTQ9HBL7 147 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 SYTL2Q9HCH5 934 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 SOHLH2Q9NX45 425 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 STMN3Q9NZ72 180 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 COQ3Q9NZJ6 369 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 IL17CQ9P0M4 197 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 TRPS1Q9UHF7 1281 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa11.21□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 A0A1W2PQ67 120 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PDZK1P1A8MUH7 402 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ZNF749O43361 778 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 SERPINB7O75635 380 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 MYBL1P10243 752 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 EPHB2P29323 1055 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 AP2B1P63010 937 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 TUBA4AP68366 448 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ZBTB17Q13105 803 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 C6orf163Q5TEZ5 329 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 KLHL35Q6PF15 583 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 KIRREL2Q6UWL6 708 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 CHSY3Q70JA7 882 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 CDC20BQ86Y33 519 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 DOLPP1Q86YN1 238 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 LILRB4Q8NHJ6 448 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 HAS2Q92819 552 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 INIPQ9NRY2 104 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PLA2G3Q9NZ20 509 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 SENP1Q9P0U3 644 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 AMACRQ9UHK6 382 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PPT2Q9UMR5 302 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 NENFQ9UMX5 172 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 EDARQ9UNE0 448 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 CDYLQ9Y232 598 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PPIL1Q9Y3C6 166 aa11.2□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 TLDC2A0PJX2 215 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 DYTNA2CJ06 578 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 E7EQ34 232 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 H7C1Q1 480 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 GSC2O15499 205 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.626e-9■■■□□ 15.8
HCG18-241ENST00000602290 VEGFDO43915 354 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PEX1O43933 1283 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 KLK8O60259 260 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ENTPD5O75356 428 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 STK10O94804 968 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 CD63P08962 238 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 HBQ1P09105 142 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 NAT1P18440 290 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 CCNFP41002 786 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PRKCIP41743 596 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 KLK7P49862 253 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 STC1P52823 247 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ARPC4P59998 168 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 CAV1Q03135 178 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PTSQ03393 145 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 TRAF2Q12933 501 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ACSBG2Q5FVE4 666 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 SHEQ5VZ18 495 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 RHBDD2Q6NTF9 364 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 C3P1Q6ZMU1 363 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PEX26Q7Z412 305 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 LRRC49Q8IUZ0 686 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 TTC30BQ8N4P2 665 aa11.19□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PAF1Q8N7H5 531 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms