RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 DSG2Q14126 1118 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 PCID2Q5JVF3 399 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 FOPNLQ96NB1 174 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF148Q9UQR1 794 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFS3O75489 264 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 BMP10O95393 424 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 EMP3P54852 163 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 HKDC1Q2TB90 917 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 GFRALQ6UXV0 394 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC6Q86X45 466 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 AMER3Q8N944 861 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf54Q8WWF1 131 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 MOCOSQ96EN8 888 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF12Q96QT6 1004 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 YIPF2Q9BWQ6 316 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ERGP11308 486 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCR2P25025 360 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 MST1P26927 711 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 NMBRP28336 390 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF75DP51815 510 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX1Q13596 522 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SUSD1Q6UWL2 747 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 MPP5Q8N3R9 675 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 CSNK1A1LQ8N752 337 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEC3Q8TD91 643 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM136AQ96C01 138 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 BIRC8Q96P09 236 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCD4Q9BRC7 762 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 C14orf105Q9NVL8 296 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 RIC8BQ9NVN3 520 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC14AQ9UNH5 594 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 NIPSNAP2O75323 286 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 MATN4O95460 622 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 WDPCPO95876 746 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGAMP11215 1152 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ARNTP27540 789 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC26A3P40879 764 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 EFNA3P52797 238 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ART3Q13508 389 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 GBX1Q14549 363 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 NAA25Q14CX7 972 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 PCOLCEQ15113 449 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 PAQR7Q86WK9 346 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 MVB12AQ96EY5 273 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 PAK5Q9P286 719 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF33A8MVX0 844 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.495e-9■□□□□ 8.4
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS26AO75436 327 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 WFS1O76024 890 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC5CO95185 931 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 HEXBP07686 556 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 UQCRHP07919 91 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 FMO4P31512 558 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF5AQ12840 1032 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT16Q17RD7 645 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 OTUD6BQ8N6M0 293 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC89Q8N998 374 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 OR9A1PQ8NGU1 263 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC120Q96HB5 630 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 DESI2Q9BSY9 194 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ZGRF1Q86YA3 2104 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXS1O43638 330 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SEL1L2Q5TEA6 688 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC8BQ6P9F7 803 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM139Q8IV31 216 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SMPDL3AQ92484 453 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 LPGAT1Q92604 370 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2A5Q96R48 311 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 TGIF2Q9GZN2 237 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF700Q9H0M5 742 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ABI3Q9P2A4 366 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 GALPQ9UBC7 116 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SVILO95425 2214 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 I3L1I5 382 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO1CO00159 1063 aa24.33■■□□□ 1.49
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