RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC2A4P14672 509 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 DIO3P55073 304 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 C21orf59P57076 290 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR18Q14330 331 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ICE2Q659A1 982 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ADNP2Q6IQ32 1131 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 LAS2Q8IYD9 372 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF175Q8N4F7 328 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ABHD11Q8NFV4 315 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP3R2Q96LZ3 170 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PIPSLA2A3N6 862 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 NPIPB8E9PQR5 432 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 PRDX6P30041 224 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 AP5B1Q2VPB7 878 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 PAGE2BQ5JRK9 111 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 MED27Q6P2C8 311 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM48Q8IWZ4 208 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 FNDC5Q8NAU1 212 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 OR4E2Q8NGC2 313 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 LMX1AQ8TE12 382 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 PELI2Q9HAT8 420 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM74BQ9NUR3 256 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 AIG1Q9NVV5 245 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 SPHK1Q9NYA1 384 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 SPASTQ9UBP0 616 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR45Q9Y5Y3 372 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 CACNA1EQ15878 2313 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A1B0GVT2 93 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 VIPP01282 170 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 PRPH2P23942 346 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 EMX2Q04743 252 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 LAPTM5Q13571 262 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 GSTA3Q16772 222 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 IMPG1Q17R60 797 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 SMU1Q2TAY7 513 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 POU5F2Q8N7G0 328 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A1B0GTW7 788 aa25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 IDO1P14902 403 aa25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 GPX3P22352 226 aa25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 ASRGL1Q7L266 308 aa25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 GKN2Q86XP6 184 aa25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF740Q8NDX6 193 aa25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 OR4K1Q8NGD4 311 aa25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 C1orf50Q9BV19 199 aa25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 BRINP2Q9C0B6 783 aa25.06■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 YY2O15391 372 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 AQP9O43315 295 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 COX4I1P13073 169 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 CTSKP43235 329 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA0040Q15053 153 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 TEAD4Q15561 434 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF423Q2M1K9 1284 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 FBXL6Q8N531 539 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 HUS1BQ8NHY5 278 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 REPS1Q96D71 796 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 CMTM5Q96DZ9 223 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 SRMSQ9H3Y6 488 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 LRTM1Q9HBL6 345 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 PILRBQ9UKJ0 227 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 VPS13AQ96RL7 3174 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 B4DGG1 531 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 BTN3A3O00478 584 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 HSD3B1P14060 373 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 HSD3B2P26439 372 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 CPA2P48052 419 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 BNC1Q01954 994 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 HERC3Q15034 1050 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 ZFAND4Q86XD8 727 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 LRMDAQ9H2I8 198 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 BRF2Q9HAW0 419 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 C1orf109Q9NX04 203 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa25.04■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 LMO7DNF2Z398 122 aa25.04■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 PIAS2O75928 621 aa25.04■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 ACADVLP49748 655 aa25.04■■□□□ 1.6
SCAMP4-210ENST00000588555 CCR8P51685 355 aa25.04■■□□□ 1.6
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