RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	SCN5A	Q14524	2016 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ILVBL	A1L0T0	632 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf226	A1L170	272 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPB2	A8KAH6	182 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TLR4	O00206	839 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MDM4	O15151	490 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CHAD	O15335	359 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFS4	O43181	175 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KLK8	O60259	260 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP9A	O75110	1047 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MTX2	O75431	263 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ERLIN1	O75477	346 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RHBDL1	O75783	438 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZWINT	O95229	277 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CSF2	P04141	144 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ICAM1	P05362	532 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LCK	P06239	509 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	UMOD	P07911	640 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR2M	P0CAP2	368 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT3	P12035	628 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SRD5A1	P18405	259 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2A7	P20853	494 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CALB2	P22676	271 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DNASE1	P24855	282 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGA3	P26006	1051 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CHAT	P28329	748 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC6A12	P48065	614 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RFX2	P48378	723 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS7	P49802	495 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SST	P61278	116 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2H	P62256	183 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMYND11	Q15326	602 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPB2	Q16082	182 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC36A3	Q495N2	470 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TCTE1	Q5JU00	501 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LCTL	Q6UWM7	567 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM219A	Q8IW50	185 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FADS6	Q8N9I5	356 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OR8K3	Q8NH51	312 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	AGR3	Q8TD06	166 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NEUROG1	Q92886	237 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OTULIN	Q96BN8	352 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	AP2M1	Q96CW1	435 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PHF21B	Q96EK2	531 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	EPSTI1	Q96J88	318 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC22A12	Q96S37	553 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CPNE1	Q99829	537 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ASCL2	Q99929	193 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PKIB	Q9C010	78 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NAPB	Q9H115	298 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	EHD1	Q9H4M9	534 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB20	Q9NX57	234 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DPP3	Q9NY33	737 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	THEG	Q9P2T0	379 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PTCH1	Q13635	1447 aa		2.68	□□□□□ -1.98

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