RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	KMO	O15229	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM16	O95361	564 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	IL33	O95760	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	AP2A1	O95782	977 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RAP2A	P10114	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RALB	P11234	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	VCL	P18206	1134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGB6	P18564	788 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ADRA1D	P25100	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	MGAT1	P26572	445 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ADRA1A	P35348	466 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	HMGCL	P35914	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	HADHA	P40939	763 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	NPY2R	P49146	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OR1D5	P58170	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PRAME	P78395	509 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CRADD	P78560	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CCL7	P80098	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	E2F1	Q01094	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CDH17	Q12864	832 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SP140	Q13342	867 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	NFATC2	Q13469	925 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PEX6	Q13608	980 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	GUSBP11	Q6P575	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PATE1	Q8WXA2	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	GLYATL1	Q969I3	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TBATA	Q96M53	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CDH19	Q9H159	772 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OR51F1	A6NGY5	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ZW10	O43264	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	VEGFD	O43915	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	AVIL	O75366	819 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	NDUFS3	O75489	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	MT-CO3	P00414	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SOD1	P00441	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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