RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SLC2A1P11166 492 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PSMB9P28065 219 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PRKCIP41743 596 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CDKN2CP42773 168 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC1A3P43003 542 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MC1RQ01726 317 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RHEBQ15382 184 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NPTX1Q15818 432 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DDIASQ8IXT1 998 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GTF2H4Q92759 462 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MYO19Q96H55 970 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PHOX2BQ99453 314 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SIAEQ9HAT2 523 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GULP1Q9UBP9 304 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AGAP5A6NIR3 686 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 J3QRK9 145 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PEX12O00623 359 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTS4O75173 837 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GJB6O95452 261 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CTSAP10619 480 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TACR2P21452 398 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PPP2R1BP30154 601 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC7A1P30825 629 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CDK10Q15131 360 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GPAT3Q53EU6 434 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AVPI1Q5T686 147 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf189Q5VU69 101 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 VITQ6UXI7 678 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NOXA1Q86UR1 476 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HPS6Q86YV9 775 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.16□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM129BQ96TA1 746 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FUZQ9BT04 418 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CNTN3Q9P232 1028 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AASSQ9UDR5 926 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PEAK1Q9H792 1746 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FCHO1O14526 889 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PTTG1O95997 202 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINA3P01011 423 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FGFR3P22607 806 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ALDH3B1P43353 468 aa6.16□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 MAP4K2Q12851 820 aa6.16□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.16□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NCSTNQ92542 709 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM203Q969S6 136 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MS4A14Q96JA4 679 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF599Q96NL3 588 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF670Q9BS34 389 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RNF32Q9H0A6 362 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MMP27Q9H306 513 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GPR34Q9UPC5 381 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EFCAB7A8K855 629 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF10BO14763 440 aa6.15□□□□□ -1.42
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