RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-209ENST00000550857 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.83□□□□□ -1.16
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PTPRB-209ENST00000550857 PMEPA1Q969W9 287 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
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