RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967	RAB1C	Q92928	201 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	SMO	Q99835	787 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	PANK3	Q9H999	370 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	COG4	Q9H9E3	785 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	LAMC1	P11047	1609 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	DAPK1	P53355	1430 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A0G2JNJ9	132 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	C1orf226	A1L170	272 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	WASH3P	C4AMC7	463 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC28A1	O00337	649 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	NR5A2	O00482	541 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	NDUFAB1	O14561	156 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	GRID2	O43424	1007 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	DFFB	O76075	338 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	ERLIN2	O94905	339 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	PIGN	O95427	931 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	ITGB3	P05106	788 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	S1PR1	P21453	382 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	IER3	P46695	156 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	VAV2	P52735	878 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	IRX4	P78413	519 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	FUT7	Q11130	342 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	ATL1	Q8WXF7	558 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	ALG3	Q92685	438 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	CPNE1	Q99829	537 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	MFF	Q9GZY8	342 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	RHCG	Q9UBD6	479 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967		Q9UFV3	132 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A1B0GUA9	196 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A1W2PPV4	95 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967		H0YGN5	161 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	HAS3	O00219	553 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	MDM4	O15151	490 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	AP5Z1	O43299	807 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	RPS6KA4	O75676	772 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	UFL1	O94874	794 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	NDUFB10	O96000	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	ALPI	P09923	528 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	RRAS	P10301	218 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF44	P15621	663 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6	2e-7	■■■□□ 18.3
ECHDC1-222	ENST00000531967	GSTM2	P28161	218 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	GLRB	P48167	497 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	CD97	P48960	835 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	RGS7	P49802	495 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	STX17	P56962	302 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	SKP1	P63208	163 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	KIR3DS1	Q14943	382 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	PON2	Q15165	354 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	COPS6	Q7L5N1	327 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM124A	Q86V42	546 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPR65	Q8IYL9	337 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR4A16	Q8NH70	328 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPX8	Q8TED1	209 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	TOP1MT	Q969P6	601 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	ORAI1	Q96D31	301 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	SGPP1	Q9BX95	441 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-222	ENST00000531967	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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