RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528036.5

PKP3-206, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-206ENST00000528036 NBASA2RRP1 2371 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 SLC16A5O15375 505 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 SP140Q13342 867 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 NADK2Q4G0N4 442 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 ZNF425Q6IV72 752 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 SUSD1Q6UWL2 747 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 COX15Q7KZN9 410 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 CNTN4Q8IWV2 1026 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.09■■□□□ 1.138e-7■■■■□ 20
PKP3-206ENST00000528036 FAM26EQ8N5C1 309 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 CABS1Q96KC9 395 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 SLC30A3Q99726 388 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 SLC6A20Q9NP91 592 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 TAC3Q9UHF0 121 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 MED13Q9UHV7 2174 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 H0YGG7 62 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 CCDC188H7C350 402 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 CCND1P24385 295 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 PAFAH1B1P43034 410 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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PKP3-206ENST00000528036 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 CUL1Q13616 776 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 RBBP7Q16576 425 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 NDUFA9Q16795 377 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 OR4N4Q8N0Y3 316 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 ZADH2Q8N4Q0 377 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 CSNK1A1LQ8N752 337 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 MIEF2Q96C03 454 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 THAP11Q96EK4 314 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 FBXL4Q9UKA2 621 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-206ENST00000528036 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 CLEC18AA5D8T8 446 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 HIST1H2ADP20671 130 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 FBLP22087 321 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 OR1D4P47884 311 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 MPP1Q00013 466 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 DSG2Q14126 1118 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 COLEC12Q5KU26 742 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 SLC6A19Q695T7 634 aa22.07■■□□□ 1.12
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PKP3-206ENST00000528036 MYO1HQ8N1T3 1032 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 CLEC18CQ8NCF0 446 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 OR2A5Q96R48 311 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 CRB3Q9BUF7 120 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 PARVBQ9HBI1 364 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 TMEM184CQ9NVA4 438 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 C14orf105Q9NVL8 296 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.07■■□□□ 1.12
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PKP3-206ENST00000528036 KRT87PA6NCN2 255 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 ANXA5P08758 320 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 ITGA3P26006 1051 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 GNG11P61952 73 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 DR1Q01658 176 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 FAM53BQ14153 422 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 BBS9Q3SYG4 887 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 IQCKQ8N0W5 287 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 STT3BQ8TCJ2 826 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 CERS2Q96G23 380 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 CTSFQ9UBX1 484 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 SOCS6O14544 535 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 IVDP26440 423 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 IMPA1P29218 277 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP3-206ENST00000528036 ARL4CP56559 192 aa22.05■■□□□ 1.12
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