RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF670Q9BS34 389 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 KCNN2Q9H2S1 579 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf78A6NCI8 922 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LEFTY2O00292 366 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 COCHO43405 550 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 GOT1P17174 413 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PFKLP17858 780 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 DSTNP60981 165 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LAPTM4AQ15012 233 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MPPE1Q53F39 396 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 DENND5AQ6IQ26 1287 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TAC4Q86UU9 113 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 A8MT66 165 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MFSD11O43934 449 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LILRB3O75022 631 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MED26O95402 600 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 UMPSP11172 480 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 DIO3P55073 304 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CDH13P55290 713 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RHAGQ02094 409 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 UBXN2BQ14CS0 331 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ZMYND11Q15326 602 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TAB1Q15750 504 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM65Q6PI78 240 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ENPP6Q6UWR7 440 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MARC2Q969Z3 335 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CSPG4P5Q96PW8 444 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 WNT6Q9Y6F9 365 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 E5RI56 91 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ACSL4O60488 711 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TBL1XO60907 577 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 DDCP20711 480 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SCNN1AP37088 669 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 FOXA1P55317 472 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TFF2Q03403 129 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CAMK1Q14012 370 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 BTBD16Q32M84 506 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 C5orf22Q49AR2 442 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF540Q8NDQ6 660 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PJA1Q8NG27 643 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 NXPE3Q969Y0 559 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 DUSP21Q9H596 190 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 UBXN8O00124 270 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 APODP05090 189 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CSHL1Q14406 222 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2J2Q8N2K1 259 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LHFPL5Q8TAF8 219 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 NUDT8Q8WV74 236 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MSANTD3Q96H12 275 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 NSMCE2Q96MF7 247 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 UBP1Q9NZI7 540 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 I3L521 148 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 BCKDKO14874 412 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MBTPS2O43462 519 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CST1P01037 141 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LAMP2P13473 410 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 OR1E1P30953 314 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 GBX1Q14549 363 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MIER2Q8N344 545 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 FBXO30Q8TB52 745 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 OTUB2Q96DC9 234 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 KCNA7Q96RP8 456 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 KCNS3Q9BQ31 491 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 NMUR1Q9HB89 426 aa9.82□□□□□ -0.84
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