RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513524.5

GPBP1-206, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, human

TSL 5

Gene GPBP1, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPBP1-206	ENST00000513524	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	UGP2	Q16851	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	EID3	Q8N140	333 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PIGB	Q92521	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PRAF2	O60831	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PAX1	P15863	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CA4	P22748	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	VAMP7	P51809	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CLDN15	P56746	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	TAF10	Q12962	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	RBBP7	Q16576	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ANO5	Q75V66	913 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ACE	P12821	1306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	GH1	P01241	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	NR1D1	P20393	614 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62	2e-6	■■■■□ 24.5
GPBP1-206	ENST00000513524	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	NPBWR1	P48145	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CACNG1	Q06432	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	TEF	Q10587	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	NCOA7	Q8NI08	942 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	KRT35	Q92764	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	P2RX5	Q93086	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	TLE6	Q9H808	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CNIH4	Q9P003	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524		A0A1W2PRV1	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SOCS5	O75159	536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	RAD51D	O75771	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SERPING1	P05155	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CA6	P23280	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CDKN1A	P38936	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FOLH1	Q04609	750 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FUT11	Q495W5	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	STPG4	Q8N801	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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