RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 FOPNLQ96NB1 174 aa28.73■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 PLCD4Q9BRC7 762 aa28.73■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 KIFC1Q9BW19 673 aa28.73■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 IDSB3KWA1 339 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 NDUFS3O75489 264 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 FBLP22087 321 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 CMPK1P30085 196 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 SLC26A3P40879 764 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 NPY2RP49146 381 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 RELAQ04206 551 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 CNSTQ6PJW8 725 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 PAQR7Q86WK9 346 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 AMER3Q8N944 861 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 DESI2Q9BSY9 194 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 CDC14AQ9UNH5 594 aa28.72■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 OTOGQ6ZRI0 2925 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 MYO1CO00159 1063 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 PRF1P14222 555 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP19Q14CB8 494 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 GARNL3Q5VVW2 1013 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF425Q6IV72 752 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 PRSS58Q8IYP2 241 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC89Q8N998 374 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 OR9A1PQ8NGU1 263 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 NR4A3Q92570 626 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 OR2A5Q96R48 311 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 C14orf105Q9NVL8 296 aa28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
ALYREF-202ENST00000505490 TRAV17A0A0B4J275 112 aa28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGEF33A8MVX0 844 aa28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 AP3B1O00203 1094 aa28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 BMP10O95393 424 aa28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 EMP2P54851 167 aa28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 ARG2P78540 354 aa28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 SNX1Q13596 522 aa28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 CCNG2Q16589 344 aa28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 MARVELD3Q96A59 401 aa28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 TCF12Q99081 682 aa28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 RNF32Q9H0A6 362 aa28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 DYTNA2CJ06 578 aa28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 H3BMM5 538 aa28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM205Q6UW68 189 aa28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 C4orf22Q6V702 233 aa28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 SMPDL3AQ92484 453 aa28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 MFSD3Q96ES6 412 aa28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 CABS1Q96KC9 395 aa28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 BFARQ9NZS9 450 aa28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 PTGFRNQ9P2B2 879 aa28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 FBN2P35556 2912 aa28.69■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 FOXS1O43638 330 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 NIPSNAP2O75323 286 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 VPS26AO75436 327 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 ESR1P03372 595 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 ERVK-10P10266 1014 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 EFNA3P52797 238 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 MRNIPQ6NTE8 343 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 FJX1Q86VR8 437 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 ACAT2Q9BWD1 397 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF700Q9H0M5 742 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 RIC8BQ9NVN3 520 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 PLA2G3Q9NZ20 509 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 GALPQ9UBC7 116 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 TRPC4Q9UBN4 977 aa28.68■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 SCN2AQ99250 2005 aa28.67■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 VAPBO95292 243 aa28.67■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 FMO4P31512 558 aa28.67■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 PCOLCEQ15113 449 aa28.67■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 HKDC1Q2TB90 917 aa28.67■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 CSNK1A1LQ8N752 337 aa28.67■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 IMMP1LQ96LU5 166 aa28.67■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 RBSNQ9H1K0 784 aa28.67■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 PDZD2O15018 2839 aa28.66■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 CXCR2P25025 360 aa28.66■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 ART3Q13508 389 aa28.66■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 ARMC3Q5W041 872 aa28.66■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 SUSD1Q6UWL2 747 aa28.66■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
ALYREF-202ENST00000505490 SIRT6Q8N6T7 355 aa28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms