RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM73Q86UV7 250 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 DTX1Q86Y01 620 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 MREGQ8N565 214 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 PDPRQ8NCN5 879 aa13.97□□□□□ -0.17
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SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF425Q6IV72 752 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 NIPAL1Q6NVV3 410 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF44Q7L0R7 432 aa13.96□□□□□ -0.17
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SH3BP2-208ENST00000504294 ABHD11Q8NFV4 315 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 TTLQ8NG68 377 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 KCTD4Q8WVF5 259 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 RHBDF1Q96CC6 855 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 SEC16BQ96JE7 1060 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 SCYL1Q96KG9 808 aa13.96□□□□□ -0.17
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SH3BP2-208ENST00000504294 PPM1MQ96MI6 270 aa13.96□□□□□ -0.17
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SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL25Q9H0H3 589 aa13.96□□□□□ -0.17
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SH3BP2-208ENST00000504294 PELI2Q9HAT8 420 aa13.96□□□□□ -0.17
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SH3BP2-208ENST00000504294 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP13.95□□□□□ -0.182e-6■□□□□ 8.6
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SH3BP2-208ENST00000504294 SUPT3HO75486 399 aa13.95□□□□□ -0.18
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SH3BP2-208ENST00000504294 TMPRSS3P57727 454 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SKP1P63208 163 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 LAPTM5Q13571 262 aa13.95□□□□□ -0.18
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SH3BP2-208ENST00000504294 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa13.95□□□□□ -0.18
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SH3BP2-208ENST00000504294 KRT78Q8N1N4 520 aa13.95□□□□□ -0.18
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SH3BP2-208ENST00000504294 EPB41L4BQ9H329 900 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 EHD1Q9H4M9 534 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM60AQ9NP50 221 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJC11Q9NVH1 559 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC14AQ9UNH5 594 aa13.95□□□□□ -0.18
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SH3BP2-208ENST00000504294 PMS2P1A4D2B8 440 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC151A5D8V7 595 aa13.94□□□□□ -0.18
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