RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 RPL21P46778 160 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 BMXP51813 675 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 CLDN15P56746 228 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 DLK1P80370 383 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 RBP5P82980 135 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 SCARB2Q14108 478 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 HERC3Q15034 1050 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 NPTX1Q15818 432 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 KIAA1644Q3SXP7 199 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 HECTD3Q5T447 861 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 LCE1CQ5T751 118 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 ARHGEF16Q5VV41 709 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 SH2D5Q6ZV89 423 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 SLC16A9Q7RTY1 509 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 SPATA19Q7Z5L4 167 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 PIGZQ86VD9 579 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 OR8H3Q8N146 312 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 KLHDC1Q8N7A1 406 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 OR4C3Q8NH37 302 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 KCNE4Q8WWG9 221 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 EXOC4Q96A65 974 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 SPAG5Q96R06 1193 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 ASCL2Q99929 193 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 VGLL1Q99990 258 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 FERMT1Q9BQL6 677 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 PIGQQ9BRB3 760 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 ADPGKQ9BRR6 497 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 GRPEL1Q9HAV7 217 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 TXNDC16Q9P2K2 825 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 CACNG5Q9UF02 275 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 TNNQ9UQP3 1299 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 C2CD2Q9Y426 696 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 STK36Q9NRP7 1315 aa2.13□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 A0A087WV48 116 aa2.12□□□□□ -2.07
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RBM39-242ENST00000498280 A0A1W2PPW3 197 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 FPGTO14772 594 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 SNX3O60493 162 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 RPS6KA5O75582 802 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 NADKO95544 446 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 IGLV1-44P01699 117 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 GPIP06744 558 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 LBPP18428 481 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 ADRA2CP18825 462 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 CA6P23280 308 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 ALDH1B1P30837 517 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 HSD17B3P37058 310 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 VAMP7P51809 220 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 MAZP56270 477 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 MTCP1P56278 107 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 PTENP60484 403 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 CDR2Q01850 454 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 BFSP1Q12934 665 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 TUBB2AQ13885 445 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
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RBM39-242ENST00000498280 PTGISQ16647 500 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 UGCGQ16739 394 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 PHKG1Q16816 387 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 ALDH1L2Q3SY69 923 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 GTDC1Q4AE62 458 aa2.12□□□□□ -2.07
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RBM39-242ENST00000498280 HPSE2Q8WWQ2 592 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 MR1Q95460 341 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 PRAC1Q96KF2 57 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 TUBB2BQ9BVA1 445 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 ZMYND12Q9H0C1 365 aa2.12□□□□□ -2.07
RBM39-242ENST00000498280 WDR13Q9H1Z4 485 aa2.12□□□□□ -2.07
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