RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	NFU1	Q9UMS0	254 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	VWA7	Q9Y334	891 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CD97	P48960	835 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PGD	P52209	483 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXK1	P85037	733 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2L3	Q8NG85	312 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB11	Q8WXH4	323 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS50	Q96JG6	964 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR21	Q99679	349 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	EPN3	Q9H201	632 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	NFS1	Q9Y697	457 aa		16.56	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PPV9	198 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2A25	A4D2G3	310 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DSCR3	O14972	297 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	HCRTR1	O43613	425 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNDBP1	O95273	360 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	HRH2	P25021	359 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CMPK1	P30085	196 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FOLR3	P41439	243 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ABAT	P80404	500 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GRTP1	Q5TC63	336 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF44	Q7L0R7	432 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FBF1	Q8TES7	1133 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	IL17F	Q96PD4	163 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CYTH2	Q99418	400 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	NDN	Q99608	321 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	16.55	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ARGFX	A6NJG6	315 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM159B	A6NKW6	160 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNDC9	O14530	226 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB14	O43829	449 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DPM1	O60762	260 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGAX	P20702	1163 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SAT1	P21673	171 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MCM3	P25205	808 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GP5	P40197	560 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GPX6	P59796	221 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	IL2	P60568	153 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MLIP	Q5VWP3	458 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PPM1N	Q8N819	430 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MVB12A	Q96EY5	273 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CUTC	Q9NTM9	273 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MED16	Q9Y2X0	877 aa		16.54	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MED13	Q9UHV7	2174 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PEX12	O00623	359 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDH17	O14917	1159 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MMP11	P24347	488 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRB3	P28472	473 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL11	P51671	97 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	POU4F1	Q01851	419 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	16.53	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	16.52	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		16.52	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC16A5	O15375	505 aa		16.52	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CTSV	O60911	334 aa		16.52	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	16.52	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ALAS2	P22557	587 aa		16.52	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	BDKRB1	P46663	353 aa		16.52	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PNLIPRP1	P54315	467 aa		16.52	■□□□□ 0.24

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