RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486917.1

PRRT1-208, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, human

TSL 5

Gene PRRT1, Length 620 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRRT1-208	ENST00000486917	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	DYTN	A2CJ06	578 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	IDS	B3KWA1	339 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PRSS44	E7EML9	344 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917		H0YGG7	62 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	NDUFS3	O75489	264 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SERPINA7	P05543	415 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ERVK-10	P10266	1014 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ARNT	P27540	789 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	NMBR	P28336	390 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ATP5D	P30049	168 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CMPK1	P30085	196 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	EMP2	P54851	167 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	KCNK10	P57789	538 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CRADD	P78560	199 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	KIF5A	Q12840	1032 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	DSG2	Q14126	1118 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	AMER3	Q8N944	861 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CABS1	Q96KC9	395 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	BIRC8	Q96P09	236 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PAK5	Q9P286	719 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	COPG2	Q9UBF2	871 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	FBN2	P35556	2912 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	FFAR3	O14843	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	GPR42	O15529	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PHF2	O75151	1096 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	BMP10	O95393	424 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CELA2A	P08217	269 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SLC26A3	P40879	764 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SNX1	Q13596	522 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	HKDC1	Q2TB90	917 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PAQR7	Q86WK9	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	LPGAT1	Q92604	370 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	DESI2	Q9BSY9	194 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	IL22	Q9GZX6	179 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	RNF32	Q9H0A6	362 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	MYO1C	O00159	1063 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	VPS26A	O75436	327 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CXCR2	P25025	360 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	EFNA3	P52797	238 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ART3	Q13508	389 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF425	Q6IV72	752 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SMPDL3A	Q92484	453 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	OR2A5	Q96R48	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	F8	P00451	2351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	FOXS1	O43638	330 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	VAPB	O95292	243 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	WDPCP	O95876	746 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	F10	P00742	488 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ITGAM	P11215	1152 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	MST1	P26927	711 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	FMO4	P31512	558 aa		13.53	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms