RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484786.5

TRAK1-208, Transcript of trafficking kinesin protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAK1, Length 2,008 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1-208ENST00000484786 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 CHRDQ9H2X0 955 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 ACTL8Q9H568 366 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 BRF2Q9HAW0 419 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 COL6A3P12111 3177 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 ANKRD28O15084 1053 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 NDUFS2O75306 463 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 CDH1P12830 882 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 MAPK1P28482 360 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 ACTR1BP42025 376 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 RAB28P51157 221 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 ACTR1AP61163 376 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 PSME3P61289 254 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 LAPTM5Q13571 262 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 C17orf64Q86WR6 236 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 HPS6Q86YV9 775 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 PJA1Q8NG27 643 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 VPS33AQ96AX1 596 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 APIPQ96GX9 242 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 CROTQ9UKG9 612 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 PIPSLA2A3N6 862 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 DYTNA2CJ06 578 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 BCKDHAP12694 445 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 AMD1P17707 334 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 DPP6P42658 865 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 PACS2Q86VP3 889 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 LAS2Q8IYD9 372 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 GJD3Q8N144 294 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 APOLD1Q96LR9 279 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 ZBTB18Q99592 522 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 DPY30Q9C005 99 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 ZMYND15Q9H091 742 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 XKR8Q9H6D3 395 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 MAP10Q9P2G4 905 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-208ENST00000484786 KDM1AO60341 852 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 TNFP01375 233 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 THEGLP0DJG4 465 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 PRPS2P11908 318 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 PKLRP30613 574 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 PIGGQ5H8A4 983 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 UBE2E3Q969T4 207 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 CLDN23Q96B33 292 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 GID8Q9NWU2 228 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 ADA2Q9NZK5 511 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 A0A1W2PPV9 198 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 EML2O95834 649 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 ACPPP15309 386 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 PSMB5P28074 263 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 ACTR3P61158 418 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.074e-12■■■■■ 40.9
TRAK1-208ENST00000484786 MTAPQ13126 283 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 KRT78Q8N1N4 520 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 POMPQ9Y244 141 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-208ENST00000484786 ASPDHA6ND91 283 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms