RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479023.5

FGD4-205, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 4

Gene FGD4, Length 535 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-205	ENST00000479023	CRABP2	P29373	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SERPINB6	P35237	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ARL3	P36405	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	RABIF	P47224	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PPP5C	P53041	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PRKCE	Q02156	737 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ENPEP	Q07075	957 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PPIL2	Q13356	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CAMK1	Q14012	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	THEM4	Q5T1C6	240 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	LIX1	Q8N485	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CYTH2	Q99418	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	RHBG	Q9H310	441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023		A0A1W2PRV1	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SYCE1L	A8MT33	242 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	HIP1	O00291	1037 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CLDN3	O15551	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ZIC3	O60481	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	GJB3	O75712	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	MLYCD	O95822	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	IL6	P05231	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FYN	P06241	537 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ETFA	P13804	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	AGA	P20933	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CHAT	P28329	748 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	HMOX2	P30519	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	MAGEA1	P43355	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ACADVL	P49748	655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	RGS19	P49795	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CCR9	P51686	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	MTTP	P55157	894 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TAS2R40	P59535	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	KLC1	Q07866	573 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CDC20	Q12834	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FADD	Q13158	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	XRCC4	Q13426	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PDK1	Q15118	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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