RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 IYDQ6PHW0 289 aa6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 EPGNQ6UW88 154 aa6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.8□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.8□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 VRK3Q8IV63 474 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 LSMEM2Q8N112 164 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 PELI3Q8N2H9 469 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 TEX9Q8N6V9 391 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 TTLQ8NG68 377 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.79□□□□□ -1.32
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