RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 FITM1A5D6W6 292 aa22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 DSCR3O14972 297 aa22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PHKG1Q16816 387 aa22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ADCK2Q7Z695 626 aa22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD12Q6UB98 2062 aa22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa22.93■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 HYKKA2RU49 373 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ARGFXA6NJG6 315 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 H0YGG7 62 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 MKRN2OSH3BPM6 223 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PIAS1O75925 651 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 FOLR3P41439 243 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 TBPL1P62380 186 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 TRADDQ15628 312 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF425Q6IV72 752 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 C8orf74Q6P047 294 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 AGTRAPQ6RW13 159 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC25Q86WR0 208 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 RAB43Q86YS6 212 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 CDKL2Q92772 493 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM54Q9BYV2 358 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 RHOJQ9H4E5 214 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 SMYD2Q9NRG4 433 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 SLC22A11Q9NSA0 550 aa22.92■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ITGAXP20702 1163 aa22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 OTX2P32243 289 aa22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 SLC7A5Q01650 507 aa22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 CPZQ66K79 652 aa22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PCBD2Q9H0N5 130 aa22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ARL15Q9NXU5 204 aa22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 TXNDC16Q9P2K2 825 aa22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 TLK1Q9UKI8 766 aa22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 BAHCC1Q9P281 2608 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 H7BY64 318 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJB5O75953 348 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PLA2G2AP14555 144 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 EZRP15311 586 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 TAS2R39P59534 338 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 CHAF1BQ13112 559 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 NAE1Q13564 534 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM207Q6UWW9 146 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 OR2Y1Q8NGV0 311 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 VPS39Q96JC1 886 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PRAP1Q96NZ9 151 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ING2Q9H160 280 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ACSS2Q9NR19 701 aa22.9■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC88CQ9P219 2028 aa22.89■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ESYT3A0FGR9 886 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 HAT1O14929 419 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SLC28A2O43868 658 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 GSTA2P09210 222 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 HRH2P25021 359 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 OR1D4P47884 311 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SLC12A2P55011 1212 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 AP1S2P56377 157 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 RELAQ04206 551 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF460Q14592 562 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SSPNQ14714 243 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 PRTGQ2VWP7 1150 aa22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms