RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SLC6A18Q96N87 628 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CDK15Q96Q40 435 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 KCNA7Q96RP8 456 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINI1Q99574 410 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MENTQ9BUN1 341 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SARGQ9BW04 601 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TWSG1Q9GZX9 223 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ANKMY1Q9P2S6 941 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CA5BQ9Y2D0 317 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GTL3 188 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 B2RBV5 119 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 GYG2O15488 501 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 YKT6O15498 198 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PRMT3O60678 531 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PEX11AO75192 247 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SEC22BO75396 215 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SLC22A3O75751 556 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PDYNP01213 254 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 TDGF1P13385 188 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 DDX5P17844 614 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 AK4P27144 223 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PIK3R1P27986 724 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 GSTM5P46439 218 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CUL3Q13618 768 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 NR6A1Q15406 480 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SPIN4Q56A73 249 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ICE2Q659A1 982 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SLC30A9Q6PML9 568 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 FAM129CQ86XR2 697 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SFRP1Q8N474 314 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 FAM46DQ8NEK8 389 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 OR7G3Q8NG95 312 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 THAP11Q96EK4 314 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 QRFPRQ96P65 431 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CENPKQ9BS16 269 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 LRMDAQ9H2I8 198 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SRMSQ9H3Y6 488 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 AIG1Q9NVV5 245 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PPV9 198 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 E7EQ34 232 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 LMO7DNF2Z398 122 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 TNFSF14O43557 240 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ATP6AP2O75787 350 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 WNT1P04628 370 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ANXA6P08133 673 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 GPX3P22352 226 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 AHRP35869 848 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ASMTP46597 345 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 FASLGP48023 281 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 FNTBP49356 437 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 KIAA0040Q15053 153 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 KIF19Q2TAC6 998 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SPATS1Q496A3 300 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 MANEAQ5SRI9 462 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms