RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412220.1

USP9YP33-201, Transcript of USP9Y pseudogene 33, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP33, Length 421 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP33-201ENST00000412220 KBTBD8Q8NFY9 601 aa3.56□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.56□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 OR2T11Q8NH01 316 aa3.56□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 KCNE4Q8WWG9 221 aa3.56□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 NSMAFQ92636 917 aa3.56□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 RAD54LQ92698 747 aa3.56□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 LITAFQ99732 161 aa3.56□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 FSD1Q9BTV5 496 aa3.56□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 ACTL8Q9H568 366 aa3.56□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 SH3GLB2Q9NR46 395 aa3.56□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 SMCHD1A6NHR9 2005 aa3.56□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 HEG1Q9ULI3 1381 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 C5orf52A6NGY3 159 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 KRT33AO76009 404 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 DDHD2O94830 711 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 VTNP04004 478 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 CEBPBP17676 345 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 CD27P26842 260 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 MAP2K2P36507 400 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 MTCP1P56278 107 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 GCNT1Q02742 428 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 PPARDQ03181 441 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 SQLEQ14534 574 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 CDO1Q16878 200 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 ARHGEF16Q5VV41 709 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 SUSD4Q5VX71 490 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 SHEQ5VZ18 495 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 NOTUMQ6P988 496 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 FAM47EQ6ZV65 393 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 SPATA21Q7Z572 469 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 ANKRD23Q86SG2 305 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 LSMEM2Q8N112 164 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 SPEM1Q8N4L4 309 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 SEPT1Q8WYJ6 367 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 SUSD6Q92537 303 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 LRR1Q96L50 414 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 ADPGKQ9BRR6 497 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 INPP5KQ9BT40 448 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 OR6C2Q9NZP2 312 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 TNNQ9UQP3 1299 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 CHKBQ9Y259 395 aa3.55□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 IL16Q14005 1332 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 A0A087WW49 117 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 A0A1W2PPW3 197 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 ARHGEF37A1IGU5 675 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 PSMD14O00487 310 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 EPHB6O15197 1021 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 MOCS3O95396 460 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 RAF1P04049 648 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 FAM58BPP0C7Q3 252 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 SPP1P10451 314 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 CASTP20810 708 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 CRKLP46109 303 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 TNK1Q13470 666 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 ITGA9Q13797 1035 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 TUBB2AQ13885 445 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 LYSMD4Q5XG99 296 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 NIPA2Q8N8Q9 360 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 P2RX5Q93086 422 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 PGM2Q96G03 612 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 C4orf45Q96LM5 186 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 C10orf90Q96M02 699 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 ASCL2Q99929 193 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 CCDC3Q9BQI4 270 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 THAP2Q9H0W7 228 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 SDCBP2Q9H190 292 aa3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.53□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 NR5A2O00482 541 aa3.53□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
USP9YP33-201ENST00000412220 IGLV1-44P01699 117 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms