RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 TCEANCQ8N8B7 351 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 OR13C4Q8NGS5 318 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 GPR152Q8TDT2 470 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 FATE1Q969F0 183 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SHISA4Q96DD7 197 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TRIM2Q9C040 744 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 IFT46Q9NQC8 304 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SRRDQ9UH36 339 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ZNF510Q9Y2H8 683 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 OR10H1Q9Y4A9 318 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TEX46H3BTG2 121 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ICMTO60725 284 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TBL1XO60907 577 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 NIPSNAP2O75323 286 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 GLUD1P00367 558 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 RABGGTBP53611 331 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 CD47Q08722 323 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 C22orf42Q6IC83 251 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 FOXRED2Q8IWF2 684 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 FAM217AQ8IXS0 508 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 HMCESQ96FZ2 354 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 EXO5Q9H790 373 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 MKS1Q9NXB0 559 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TMEM181Q9P2C4 612 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 A6NL46 340 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 CDC7O00311 574 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 C1RP00736 705 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 FSHRP23945 695 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TCEAL1Q15170 157 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 AGAP6Q5VW22 663 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SSX6Q7RTT6 188 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SNX20Q7Z614 316 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ZNF597Q96LX8 424 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 AGAP4Q96P64 663 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 NMUR1Q9HB89 426 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SPG21Q9NZD8 308 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 FFAR2O15552 330 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 CH25HO95992 272 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 LCKP06239 509 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PLD1Q13393 1074 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 CERS6Q6ZMG9 384 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ZNF627Q7L945 461 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TAC4Q86UU9 113 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PLCZ1Q86YW0 608 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 FTMTQ8N4E7 242 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 OR4C6Q8NH72 309 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 OR5AK3PQ8NH89 298 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SLC9A6Q92581 669 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TFAP2CQ92754 450 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 MYRFLQ96LU7 910 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SIAEQ9HAT2 523 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TPT1P8Q9HAU6 139 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 RHCGQ9UBD6 479 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ASF1AQ9Y294 204 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 MYH6P13533 1939 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PQH9 124 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PRQ8 180 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PPEF2O14830 753 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 IL1BP01584 269 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ESR1P03372 595 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ALDH2P05091 517 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PRPS1L1P21108 318 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 HTR1EP28566 365 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 MAPK8P45983 427 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms